Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TM2D3Q9BRN9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TM2D3Q9BRN9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms