Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQL6

FERMT1, Fermitin family homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FERMT1Q9BQL6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FERMT1Q9BQL6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FERMT1Q9BQL6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FERMT1Q9BQL6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FERMT1Q9BQL6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FERMT1Q9BQL6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FERMT1Q9BQL6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FERMT1Q9BQL6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FERMT1Q9BQL6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FERMT1Q9BQL6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FERMT1Q9BQL6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FERMT1Q9BQL6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FERMT1Q9BQL6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FERMT1Q9BQL6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FERMT1Q9BQL6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FERMT1Q9BQL6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FERMT1Q9BQL6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FERMT1Q9BQL6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FERMT1Q9BQL6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FERMT1Q9BQL6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FERMT1Q9BQL6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FERMT1Q9BQL6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FERMT1Q9BQL6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FERMT1Q9BQL6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FERMT1Q9BQL6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FERMT1Q9BQL6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FERMT1Q9BQL6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FERMT1Q9BQL6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FERMT1Q9BQL6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FERMT1Q9BQL6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FERMT1Q9BQL6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FERMT1Q9BQL6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FERMT1Q9BQL6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FERMT1Q9BQL6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FERMT1Q9BQL6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FERMT1Q9BQL6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FERMT1Q9BQL6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FERMT1Q9BQL6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FERMT1Q9BQL6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FERMT1Q9BQL6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FERMT1Q9BQL6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FERMT1Q9BQL6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FERMT1Q9BQL6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FERMT1Q9BQL6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FERMT1Q9BQL6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FERMT1Q9BQL6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FERMT1Q9BQL6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FERMT1Q9BQL6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FERMT1Q9BQL6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FERMT1Q9BQL6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FERMT1Q9BQL6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FERMT1Q9BQL6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FERMT1Q9BQL6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FERMT1Q9BQL6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FERMT1Q9BQL6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
FERMT1Q9BQL6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FERMT1Q9BQL6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FERMT1Q9BQL6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FERMT1Q9BQL6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FERMT1Q9BQL6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FERMT1Q9BQL6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FERMT1Q9BQL6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FERMT1Q9BQL6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FERMT1Q9BQL6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FERMT1Q9BQL6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FERMT1Q9BQL6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FERMT1Q9BQL6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FERMT1Q9BQL6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FERMT1Q9BQL6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FERMT1Q9BQL6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FERMT1Q9BQL6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FERMT1Q9BQL6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FERMT1Q9BQL6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FERMT1Q9BQL6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FERMT1Q9BQL6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FERMT1Q9BQL6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FERMT1Q9BQL6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FERMT1Q9BQL6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FERMT1Q9BQL6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FERMT1Q9BQL6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FERMT1Q9BQL6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FERMT1Q9BQL6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FERMT1Q9BQL6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FERMT1Q9BQL6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FERMT1Q9BQL6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FERMT1Q9BQL6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FERMT1Q9BQL6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FERMT1Q9BQL6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FERMT1Q9BQL6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FERMT1Q9BQL6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FERMT1Q9BQL6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FERMT1Q9BQL6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FERMT1Q9BQL6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FERMT1Q9BQL6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FERMT1Q9BQL6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FERMT1Q9BQL6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FERMT1Q9BQL6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FERMT1Q9BQL6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FERMT1Q9BQL6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FERMT1Q9BQL6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms