Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LPIN3Q9BQK8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LPIN3Q9BQK8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LPIN3Q9BQK8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LPIN3Q9BQK8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LPIN3Q9BQK8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LPIN3Q9BQK8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LPIN3Q9BQK8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LPIN3Q9BQK8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LPIN3Q9BQK8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LPIN3Q9BQK8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LPIN3Q9BQK8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LPIN3Q9BQK8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LPIN3Q9BQK8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
LPIN3Q9BQK8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LPIN3Q9BQK8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LPIN3Q9BQK8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LPIN3Q9BQK8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LPIN3Q9BQK8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LPIN3Q9BQK8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LPIN3Q9BQK8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LPIN3Q9BQK8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LPIN3Q9BQK8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LPIN3Q9BQK8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LPIN3Q9BQK8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LPIN3Q9BQK8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LPIN3Q9BQK8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LPIN3Q9BQK8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LPIN3Q9BQK8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LPIN3Q9BQK8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LPIN3Q9BQK8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LPIN3Q9BQK8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LPIN3Q9BQK8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LPIN3Q9BQK8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LPIN3Q9BQK8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LPIN3Q9BQK8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LPIN3Q9BQK8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LPIN3Q9BQK8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LPIN3Q9BQK8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LPIN3Q9BQK8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LPIN3Q9BQK8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LPIN3Q9BQK8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LPIN3Q9BQK8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LPIN3Q9BQK8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms