Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCF25Q9BQ70 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCF25Q9BQ70 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCF25Q9BQ70 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCF25Q9BQ70 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCF25Q9BQ70 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCF25Q9BQ70 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCF25Q9BQ70 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCF25Q9BQ70 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TCF25Q9BQ70 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TCF25Q9BQ70 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TCF25Q9BQ70 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TCF25Q9BQ70 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCF25Q9BQ70 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCF25Q9BQ70 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCF25Q9BQ70 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCF25Q9BQ70 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCF25Q9BQ70 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCF25Q9BQ70 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCF25Q9BQ70 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCF25Q9BQ70 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCF25Q9BQ70 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCF25Q9BQ70 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCF25Q9BQ70 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCF25Q9BQ70 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCF25Q9BQ70 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCF25Q9BQ70 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCF25Q9BQ70 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCF25Q9BQ70 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCF25Q9BQ70 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCF25Q9BQ70 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCF25Q9BQ70 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCF25Q9BQ70 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCF25Q9BQ70 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCF25Q9BQ70 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCF25Q9BQ70 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TCF25Q9BQ70 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCF25Q9BQ70 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TCF25Q9BQ70 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCF25Q9BQ70 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCF25Q9BQ70 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TCF25Q9BQ70 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TCF25Q9BQ70 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TCF25Q9BQ70 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCF25Q9BQ70 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TCF25Q9BQ70 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCF25Q9BQ70 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCF25Q9BQ70 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TCF25Q9BQ70 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TCF25Q9BQ70 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCF25Q9BQ70 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCF25Q9BQ70 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCF25Q9BQ70 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TCF25Q9BQ70 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCF25Q9BQ70 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCF25Q9BQ70 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCF25Q9BQ70 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCF25Q9BQ70 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCF25Q9BQ70 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCF25Q9BQ70 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCF25Q9BQ70 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCF25Q9BQ70 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TCF25Q9BQ70 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCF25Q9BQ70 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCF25Q9BQ70 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCF25Q9BQ70 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCF25Q9BQ70 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCF25Q9BQ70 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCF25Q9BQ70 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCF25Q9BQ70 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCF25Q9BQ70 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCF25Q9BQ70 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCF25Q9BQ70 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCF25Q9BQ70 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCF25Q9BQ70 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCF25Q9BQ70 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TCF25Q9BQ70 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TCF25Q9BQ70 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TCF25Q9BQ70 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TCF25Q9BQ70 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TCF25Q9BQ70 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TCF25Q9BQ70 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCF25Q9BQ70 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCF25Q9BQ70 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCF25Q9BQ70 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCF25Q9BQ70 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCF25Q9BQ70 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCF25Q9BQ70 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCF25Q9BQ70 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCF25Q9BQ70 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCF25Q9BQ70 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCF25Q9BQ70 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCF25Q9BQ70 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCF25Q9BQ70 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCF25Q9BQ70 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCF25Q9BQ70 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCF25Q9BQ70 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCF25Q9BQ70 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCF25Q9BQ70 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCF25Q9BQ70 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms