Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TREX2Q9BQ50 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TREX2Q9BQ50 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TREX2Q9BQ50 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TREX2Q9BQ50 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TREX2Q9BQ50 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TREX2Q9BQ50 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TREX2Q9BQ50 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TREX2Q9BQ50 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TREX2Q9BQ50 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TREX2Q9BQ50 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TREX2Q9BQ50 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TREX2Q9BQ50 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TREX2Q9BQ50 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TREX2Q9BQ50 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TREX2Q9BQ50 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TREX2Q9BQ50 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TREX2Q9BQ50 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TREX2Q9BQ50 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TREX2Q9BQ50 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TREX2Q9BQ50 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TREX2Q9BQ50 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TREX2Q9BQ50 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TREX2Q9BQ50 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TREX2Q9BQ50 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TREX2Q9BQ50 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TREX2Q9BQ50 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TREX2Q9BQ50 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TREX2Q9BQ50 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TREX2Q9BQ50 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TREX2Q9BQ50 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TREX2Q9BQ50 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TREX2Q9BQ50 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TREX2Q9BQ50 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TREX2Q9BQ50 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TREX2Q9BQ50 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TREX2Q9BQ50 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TREX2Q9BQ50 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TREX2Q9BQ50 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TREX2Q9BQ50 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TREX2Q9BQ50 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TREX2Q9BQ50 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TREX2Q9BQ50 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TREX2Q9BQ50 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TREX2Q9BQ50 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TREX2Q9BQ50 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TREX2Q9BQ50 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TREX2Q9BQ50 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TREX2Q9BQ50 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TREX2Q9BQ50 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TREX2Q9BQ50 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TREX2Q9BQ50 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TREX2Q9BQ50 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TREX2Q9BQ50 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TREX2Q9BQ50 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TREX2Q9BQ50 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TREX2Q9BQ50 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TREX2Q9BQ50 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TREX2Q9BQ50 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TREX2Q9BQ50 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TREX2Q9BQ50 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TREX2Q9BQ50 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TREX2Q9BQ50 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TREX2Q9BQ50 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TREX2Q9BQ50 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TREX2Q9BQ50 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TREX2Q9BQ50 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TREX2Q9BQ50 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TREX2Q9BQ50 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TREX2Q9BQ50 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TREX2Q9BQ50 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TREX2Q9BQ50 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TREX2Q9BQ50 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TREX2Q9BQ50 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TREX2Q9BQ50 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TREX2Q9BQ50 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TREX2Q9BQ50 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TREX2Q9BQ50 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TREX2Q9BQ50 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TREX2Q9BQ50 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms