Protein–RNA interactions for Protein: Q99816

TSG101, Tumor susceptibility gene 101 protein, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101Q99816 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TSG101Q99816 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSG101Q99816 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSG101Q99816 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSG101Q99816 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSG101Q99816 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSG101Q99816 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TSG101Q99816 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSG101Q99816 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSG101Q99816 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSG101Q99816 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSG101Q99816 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TSG101Q99816 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TSG101Q99816 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSG101Q99816 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSG101Q99816 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSG101Q99816 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSG101Q99816 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSG101Q99816 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSG101Q99816 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSG101Q99816 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSG101Q99816 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSG101Q99816 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSG101Q99816 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TSG101Q99816 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSG101Q99816 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSG101Q99816 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSG101Q99816 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSG101Q99816 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSG101Q99816 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TSG101Q99816 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TSG101Q99816 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSG101Q99816 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSG101Q99816 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSG101Q99816 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSG101Q99816 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TSG101Q99816 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSG101Q99816 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSG101Q99816 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSG101Q99816 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSG101Q99816 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSG101Q99816 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSG101Q99816 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSG101Q99816 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSG101Q99816 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSG101Q99816 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSG101Q99816 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSG101Q99816 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSG101Q99816 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TSG101Q99816 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TSG101Q99816 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TSG101Q99816 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSG101Q99816 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSG101Q99816 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSG101Q99816 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSG101Q99816 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSG101Q99816 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSG101Q99816 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSG101Q99816 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSG101Q99816 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSG101Q99816 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSG101Q99816 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSG101Q99816 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSG101Q99816 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSG101Q99816 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSG101Q99816 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSG101Q99816 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSG101Q99816 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSG101Q99816 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSG101Q99816 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSG101Q99816 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSG101Q99816 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSG101Q99816 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSG101Q99816 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSG101Q99816 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSG101Q99816 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSG101Q99816 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSG101Q99816 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSG101Q99816 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSG101Q99816 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSG101Q99816 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSG101Q99816 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSG101Q99816 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSG101Q99816 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TSG101Q99816 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TSG101Q99816 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TSG101Q99816 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TSG101Q99816 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSG101Q99816 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSG101Q99816 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSG101Q99816 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSG101Q99816 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSG101Q99816 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSG101Q99816 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSG101Q99816 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSG101Q99816 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSG101Q99816 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSG101Q99816 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSG101Q99816 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSG101Q99816 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms