Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF18Q99633 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF18Q99633 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF18Q99633 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF18Q99633 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF18Q99633 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF18Q99633 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF18Q99633 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF18Q99633 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF18Q99633 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF18Q99633 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF18Q99633 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF18Q99633 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF18Q99633 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF18Q99633 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF18Q99633 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF18Q99633 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF18Q99633 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF18Q99633 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF18Q99633 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF18Q99633 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF18Q99633 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF18Q99633 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF18Q99633 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF18Q99633 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF18Q99633 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF18Q99633 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF18Q99633 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF18Q99633 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF18Q99633 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF18Q99633 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF18Q99633 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF18Q99633 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF18Q99633 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF18Q99633 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF18Q99633 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF18Q99633 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF18Q99633 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF18Q99633 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF18Q99633 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF18Q99633 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF18Q99633 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF18Q99633 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF18Q99633 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF18Q99633 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF18Q99633 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF18Q99633 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF18Q99633 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF18Q99633 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF18Q99633 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF18Q99633 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF18Q99633 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF18Q99633 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF18Q99633 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF18Q99633 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF18Q99633 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms