Protein–RNA interactions for Protein: Q99467

CD180, CD180 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD180Q99467 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD180Q99467 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD180Q99467 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD180Q99467 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD180Q99467 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD180Q99467 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD180Q99467 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD180Q99467 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD180Q99467 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD180Q99467 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD180Q99467 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD180Q99467 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD180Q99467 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD180Q99467 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD180Q99467 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD180Q99467 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CD180Q99467 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD180Q99467 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD180Q99467 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD180Q99467 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD180Q99467 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD180Q99467 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CD180Q99467 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD180Q99467 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CD180Q99467 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CD180Q99467 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD180Q99467 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD180Q99467 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD180Q99467 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD180Q99467 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CD180Q99467 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CD180Q99467 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD180Q99467 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD180Q99467 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CD180Q99467 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CD180Q99467 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD180Q99467 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD180Q99467 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD180Q99467 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CD180Q99467 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD180Q99467 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD180Q99467 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD180Q99467 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD180Q99467 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD180Q99467 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD180Q99467 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD180Q99467 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD180Q99467 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD180Q99467 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD180Q99467 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD180Q99467 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD180Q99467 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD180Q99467 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD180Q99467 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD180Q99467 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD180Q99467 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD180Q99467 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD180Q99467 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD180Q99467 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD180Q99467 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD180Q99467 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD180Q99467 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CD180Q99467 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD180Q99467 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD180Q99467 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD180Q99467 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD180Q99467 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD180Q99467 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD180Q99467 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CD180Q99467 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD180Q99467 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD180Q99467 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD180Q99467 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD180Q99467 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD180Q99467 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD180Q99467 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD180Q99467 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD180Q99467 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD180Q99467 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD180Q99467 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD180Q99467 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD180Q99467 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD180Q99467 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD180Q99467 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD180Q99467 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD180Q99467 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD180Q99467 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD180Q99467 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD180Q99467 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD180Q99467 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD180Q99467 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD180Q99467 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD180Q99467 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD180Q99467 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD180Q99467 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD180Q99467 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD180Q99467 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD180Q99467 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD180Q99467 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD180Q99467 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms