Protein–RNA interactions for Protein: Q99435

NELL2, Protein kinase C-binding protein NELL2, humanhuman

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Length 816 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELL2Q99435 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NELL2Q99435 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NELL2Q99435 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NELL2Q99435 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NELL2Q99435 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NELL2Q99435 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NELL2Q99435 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NELL2Q99435 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NELL2Q99435 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NELL2Q99435 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NELL2Q99435 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NELL2Q99435 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NELL2Q99435 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NELL2Q99435 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NELL2Q99435 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NELL2Q99435 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NELL2Q99435 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NELL2Q99435 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NELL2Q99435 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NELL2Q99435 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NELL2Q99435 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NELL2Q99435 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NELL2Q99435 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NELL2Q99435 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NELL2Q99435 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NELL2Q99435 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NELL2Q99435 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NELL2Q99435 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NELL2Q99435 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NELL2Q99435 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NELL2Q99435 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NELL2Q99435 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NELL2Q99435 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NELL2Q99435 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NELL2Q99435 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NELL2Q99435 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NELL2Q99435 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NELL2Q99435 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NELL2Q99435 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NELL2Q99435 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NELL2Q99435 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NELL2Q99435 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NELL2Q99435 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NELL2Q99435 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NELL2Q99435 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NELL2Q99435 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NELL2Q99435 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NELL2Q99435 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NELL2Q99435 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NELL2Q99435 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NELL2Q99435 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NELL2Q99435 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NELL2Q99435 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NELL2Q99435 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NELL2Q99435 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NELL2Q99435 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NELL2Q99435 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NELL2Q99435 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NELL2Q99435 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NELL2Q99435 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NELL2Q99435 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NELL2Q99435 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NELL2Q99435 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NELL2Q99435 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NELL2Q99435 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NELL2Q99435 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NELL2Q99435 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NELL2Q99435 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NELL2Q99435 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NELL2Q99435 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NELL2Q99435 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NELL2Q99435 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NELL2Q99435 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NELL2Q99435 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NELL2Q99435 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NELL2Q99435 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NELL2Q99435 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NELL2Q99435 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NELL2Q99435 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NELL2Q99435 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NELL2Q99435 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NELL2Q99435 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NELL2Q99435 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NELL2Q99435 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NELL2Q99435 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NELL2Q99435 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NELL2Q99435 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NELL2Q99435 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NELL2Q99435 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NELL2Q99435 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NELL2Q99435 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NELL2Q99435 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NELL2Q99435 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NELL2Q99435 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NELL2Q99435 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NELL2Q99435 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NELL2Q99435 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NELL2Q99435 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NELL2Q99435 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NELL2Q99435 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
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