Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF12Q99081 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF12Q99081 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF12Q99081 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF12Q99081 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF12Q99081 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF12Q99081 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF12Q99081 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF12Q99081 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF12Q99081 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF12Q99081 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF12Q99081 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF12Q99081 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF12Q99081 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF12Q99081 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF12Q99081 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCF12Q99081 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCF12Q99081 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCF12Q99081 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCF12Q99081 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCF12Q99081 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCF12Q99081 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCF12Q99081 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCF12Q99081 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCF12Q99081 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCF12Q99081 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCF12Q99081 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCF12Q99081 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TCF12Q99081 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCF12Q99081 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCF12Q99081 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF12Q99081 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF12Q99081 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF12Q99081 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCF12Q99081 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCF12Q99081 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCF12Q99081 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCF12Q99081 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCF12Q99081 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCF12Q99081 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCF12Q99081 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCF12Q99081 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCF12Q99081 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCF12Q99081 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCF12Q99081 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCF12Q99081 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCF12Q99081 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCF12Q99081 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCF12Q99081 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCF12Q99081 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCF12Q99081 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCF12Q99081 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCF12Q99081 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCF12Q99081 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCF12Q99081 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCF12Q99081 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCF12Q99081 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCF12Q99081 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TCF12Q99081 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms