Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PNKPQ96T60 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PNKPQ96T60 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PNKPQ96T60 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PNKPQ96T60 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PNKPQ96T60 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PNKPQ96T60 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PNKPQ96T60 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PNKPQ96T60 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PNKPQ96T60 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PNKPQ96T60 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PNKPQ96T60 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PNKPQ96T60 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PNKPQ96T60 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PNKPQ96T60 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PNKPQ96T60 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PNKPQ96T60 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PNKPQ96T60 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PNKPQ96T60 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PNKPQ96T60 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PNKPQ96T60 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PNKPQ96T60 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PNKPQ96T60 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PNKPQ96T60 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PNKPQ96T60 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PNKPQ96T60 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PNKPQ96T60 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PNKPQ96T60 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PNKPQ96T60 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PNKPQ96T60 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PNKPQ96T60 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PNKPQ96T60 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PNKPQ96T60 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PNKPQ96T60 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PNKPQ96T60 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PNKPQ96T60 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PNKPQ96T60 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PNKPQ96T60 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PNKPQ96T60 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PNKPQ96T60 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PNKPQ96T60 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PNKPQ96T60 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PNKPQ96T60 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PNKPQ96T60 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PNKPQ96T60 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PNKPQ96T60 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PNKPQ96T60 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PNKPQ96T60 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PNKPQ96T60 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PNKPQ96T60 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PNKPQ96T60 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PNKPQ96T60 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PNKPQ96T60 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PNKPQ96T60 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PNKPQ96T60 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PNKPQ96T60 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PNKPQ96T60 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PNKPQ96T60 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PNKPQ96T60 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PNKPQ96T60 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PNKPQ96T60 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PNKPQ96T60 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PNKPQ96T60 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PNKPQ96T60 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PNKPQ96T60 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PNKPQ96T60 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PNKPQ96T60 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNKPQ96T60 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNKPQ96T60 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PNKPQ96T60 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNKPQ96T60 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PNKPQ96T60 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PNKPQ96T60 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PNKPQ96T60 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PNKPQ96T60 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PNKPQ96T60 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PNKPQ96T60 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PNKPQ96T60 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNKPQ96T60 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNKPQ96T60 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNKPQ96T60 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNKPQ96T60 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNKPQ96T60 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNKPQ96T60 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNKPQ96T60 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNKPQ96T60 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNKPQ96T60 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNKPQ96T60 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNKPQ96T60 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNKPQ96T60 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNKPQ96T60 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PNKPQ96T60 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNKPQ96T60 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNKPQ96T60 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNKPQ96T60 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PNKPQ96T60 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PNKPQ96T60 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PNKPQ96T60 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PNKPQ96T60 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PNKPQ96T60 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms