Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST8

CEP89, Centrosomal protein of 89 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP89Q96ST8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CEP89Q96ST8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CEP89Q96ST8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CEP89Q96ST8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CEP89Q96ST8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CEP89Q96ST8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CEP89Q96ST8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CEP89Q96ST8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CEP89Q96ST8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CEP89Q96ST8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CEP89Q96ST8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CEP89Q96ST8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CEP89Q96ST8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CEP89Q96ST8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP89Q96ST8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP89Q96ST8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP89Q96ST8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CEP89Q96ST8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CEP89Q96ST8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CEP89Q96ST8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CEP89Q96ST8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CEP89Q96ST8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CEP89Q96ST8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CEP89Q96ST8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CEP89Q96ST8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CEP89Q96ST8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CEP89Q96ST8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CEP89Q96ST8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CEP89Q96ST8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CEP89Q96ST8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CEP89Q96ST8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CEP89Q96ST8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CEP89Q96ST8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CEP89Q96ST8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CEP89Q96ST8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CEP89Q96ST8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CEP89Q96ST8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CEP89Q96ST8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CEP89Q96ST8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CEP89Q96ST8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CEP89Q96ST8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CEP89Q96ST8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CEP89Q96ST8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CEP89Q96ST8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CEP89Q96ST8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CEP89Q96ST8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CEP89Q96ST8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CEP89Q96ST8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CEP89Q96ST8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CEP89Q96ST8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CEP89Q96ST8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CEP89Q96ST8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CEP89Q96ST8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CEP89Q96ST8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CEP89Q96ST8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP89Q96ST8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP89Q96ST8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP89Q96ST8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP89Q96ST8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP89Q96ST8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CEP89Q96ST8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CEP89Q96ST8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CEP89Q96ST8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CEP89Q96ST8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CEP89Q96ST8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CEP89Q96ST8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CEP89Q96ST8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP89Q96ST8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP89Q96ST8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP89Q96ST8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP89Q96ST8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP89Q96ST8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP89Q96ST8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP89Q96ST8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP89Q96ST8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP89Q96ST8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP89Q96ST8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP89Q96ST8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP89Q96ST8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP89Q96ST8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP89Q96ST8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP89Q96ST8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP89Q96ST8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CEP89Q96ST8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CEP89Q96ST8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CEP89Q96ST8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CEP89Q96ST8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CEP89Q96ST8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CEP89Q96ST8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CEP89Q96ST8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CEP89Q96ST8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CEP89Q96ST8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CEP89Q96ST8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CEP89Q96ST8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CEP89Q96ST8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CEP89Q96ST8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CEP89Q96ST8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CEP89Q96ST8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CEP89Q96ST8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CEP89Q96ST8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms