Protein–RNA interactions for Protein: Q96SM3

CPXM1, Probable carboxypeptidase X1, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPXM1Q96SM3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPXM1Q96SM3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPXM1Q96SM3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPXM1Q96SM3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPXM1Q96SM3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPXM1Q96SM3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPXM1Q96SM3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CPXM1Q96SM3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPXM1Q96SM3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CPXM1Q96SM3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPXM1Q96SM3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPXM1Q96SM3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPXM1Q96SM3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CPXM1Q96SM3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CPXM1Q96SM3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPXM1Q96SM3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPXM1Q96SM3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPXM1Q96SM3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPXM1Q96SM3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPXM1Q96SM3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPXM1Q96SM3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPXM1Q96SM3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPXM1Q96SM3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPXM1Q96SM3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPXM1Q96SM3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPXM1Q96SM3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPXM1Q96SM3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPXM1Q96SM3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CPXM1Q96SM3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPXM1Q96SM3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPXM1Q96SM3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPXM1Q96SM3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPXM1Q96SM3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPXM1Q96SM3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPXM1Q96SM3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPXM1Q96SM3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPXM1Q96SM3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPXM1Q96SM3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPXM1Q96SM3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPXM1Q96SM3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPXM1Q96SM3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPXM1Q96SM3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPXM1Q96SM3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPXM1Q96SM3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPXM1Q96SM3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CPXM1Q96SM3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPXM1Q96SM3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CPXM1Q96SM3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CPXM1Q96SM3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CPXM1Q96SM3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CPXM1Q96SM3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CPXM1Q96SM3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPXM1Q96SM3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPXM1Q96SM3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPXM1Q96SM3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CPXM1Q96SM3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPXM1Q96SM3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPXM1Q96SM3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPXM1Q96SM3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPXM1Q96SM3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPXM1Q96SM3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CPXM1Q96SM3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPXM1Q96SM3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPXM1Q96SM3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPXM1Q96SM3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPXM1Q96SM3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPXM1Q96SM3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPXM1Q96SM3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPXM1Q96SM3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPXM1Q96SM3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPXM1Q96SM3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPXM1Q96SM3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPXM1Q96SM3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPXM1Q96SM3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPXM1Q96SM3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPXM1Q96SM3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPXM1Q96SM3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPXM1Q96SM3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPXM1Q96SM3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPXM1Q96SM3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPXM1Q96SM3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPXM1Q96SM3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPXM1Q96SM3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CPXM1Q96SM3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPXM1Q96SM3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPXM1Q96SM3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPXM1Q96SM3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPXM1Q96SM3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPXM1Q96SM3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPXM1Q96SM3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CPXM1Q96SM3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPXM1Q96SM3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPXM1Q96SM3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPXM1Q96SM3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPXM1Q96SM3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPXM1Q96SM3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPXM1Q96SM3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPXM1Q96SM3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPXM1Q96SM3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPXM1Q96SM3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms