Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY7

CLIC6, Chloride intracellular channel protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC6Q96NY7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLIC6Q96NY7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIC6Q96NY7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIC6Q96NY7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIC6Q96NY7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIC6Q96NY7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIC6Q96NY7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIC6Q96NY7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIC6Q96NY7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIC6Q96NY7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIC6Q96NY7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIC6Q96NY7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CLIC6Q96NY7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLIC6Q96NY7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLIC6Q96NY7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLIC6Q96NY7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLIC6Q96NY7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLIC6Q96NY7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLIC6Q96NY7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLIC6Q96NY7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLIC6Q96NY7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLIC6Q96NY7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLIC6Q96NY7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLIC6Q96NY7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLIC6Q96NY7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLIC6Q96NY7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLIC6Q96NY7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLIC6Q96NY7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLIC6Q96NY7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLIC6Q96NY7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLIC6Q96NY7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLIC6Q96NY7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLIC6Q96NY7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLIC6Q96NY7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CLIC6Q96NY7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLIC6Q96NY7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLIC6Q96NY7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLIC6Q96NY7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLIC6Q96NY7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLIC6Q96NY7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLIC6Q96NY7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLIC6Q96NY7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLIC6Q96NY7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLIC6Q96NY7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLIC6Q96NY7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLIC6Q96NY7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CLIC6Q96NY7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLIC6Q96NY7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLIC6Q96NY7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLIC6Q96NY7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLIC6Q96NY7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLIC6Q96NY7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLIC6Q96NY7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLIC6Q96NY7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLIC6Q96NY7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLIC6Q96NY7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLIC6Q96NY7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLIC6Q96NY7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLIC6Q96NY7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLIC6Q96NY7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLIC6Q96NY7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLIC6Q96NY7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLIC6Q96NY7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLIC6Q96NY7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLIC6Q96NY7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLIC6Q96NY7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLIC6Q96NY7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms