Protein–RNA interactions for Protein: Q96N77

ZNF641, Zinc finger protein 641, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF641Q96N77 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF641Q96N77 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF641Q96N77 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF641Q96N77 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF641Q96N77 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF641Q96N77 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF641Q96N77 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF641Q96N77 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF641Q96N77 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF641Q96N77 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF641Q96N77 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF641Q96N77 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF641Q96N77 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF641Q96N77 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF641Q96N77 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF641Q96N77 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF641Q96N77 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF641Q96N77 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF641Q96N77 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF641Q96N77 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF641Q96N77 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF641Q96N77 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF641Q96N77 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF641Q96N77 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF641Q96N77 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF641Q96N77 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF641Q96N77 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF641Q96N77 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF641Q96N77 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF641Q96N77 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF641Q96N77 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF641Q96N77 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF641Q96N77 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF641Q96N77 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF641Q96N77 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF641Q96N77 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF641Q96N77 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF641Q96N77 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF641Q96N77 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF641Q96N77 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF641Q96N77 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF641Q96N77 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF641Q96N77 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF641Q96N77 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF641Q96N77 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF641Q96N77 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF641Q96N77 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF641Q96N77 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF641Q96N77 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF641Q96N77 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF641Q96N77 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF641Q96N77 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF641Q96N77 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF641Q96N77 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF641Q96N77 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF641Q96N77 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF641Q96N77 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF641Q96N77 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF641Q96N77 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms