Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
YTHDC1Q96MU7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
YTHDC1Q96MU7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
YTHDC1Q96MU7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
YTHDC1Q96MU7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
YTHDC1Q96MU7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
YTHDC1Q96MU7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
YTHDC1Q96MU7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
YTHDC1Q96MU7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
YTHDC1Q96MU7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
YTHDC1Q96MU7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
YTHDC1Q96MU7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
YTHDC1Q96MU7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
YTHDC1Q96MU7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
YTHDC1Q96MU7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
YTHDC1Q96MU7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
YTHDC1Q96MU7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
YTHDC1Q96MU7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
YTHDC1Q96MU7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
YTHDC1Q96MU7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
YTHDC1Q96MU7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
YTHDC1Q96MU7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
YTHDC1Q96MU7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
YTHDC1Q96MU7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
YTHDC1Q96MU7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
YTHDC1Q96MU7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
YTHDC1Q96MU7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
YTHDC1Q96MU7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
YTHDC1Q96MU7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
YTHDC1Q96MU7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
YTHDC1Q96MU7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
YTHDC1Q96MU7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
YTHDC1Q96MU7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
YTHDC1Q96MU7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
YTHDC1Q96MU7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
YTHDC1Q96MU7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
YTHDC1Q96MU7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
YTHDC1Q96MU7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
YTHDC1Q96MU7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
YTHDC1Q96MU7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
YTHDC1Q96MU7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
YTHDC1Q96MU7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
YTHDC1Q96MU7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
YTHDC1Q96MU7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
YTHDC1Q96MU7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
YTHDC1Q96MU7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
YTHDC1Q96MU7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
YTHDC1Q96MU7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
YTHDC1Q96MU7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
YTHDC1Q96MU7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
YTHDC1Q96MU7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
YTHDC1Q96MU7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
YTHDC1Q96MU7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
YTHDC1Q96MU7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
YTHDC1Q96MU7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
YTHDC1Q96MU7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
YTHDC1Q96MU7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
YTHDC1Q96MU7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
YTHDC1Q96MU7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
YTHDC1Q96MU7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
YTHDC1Q96MU7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
YTHDC1Q96MU7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
YTHDC1Q96MU7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
YTHDC1Q96MU7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
YTHDC1Q96MU7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
YTHDC1Q96MU7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
YTHDC1Q96MU7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
YTHDC1Q96MU7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
YTHDC1Q96MU7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
YTHDC1Q96MU7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
YTHDC1Q96MU7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
YTHDC1Q96MU7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
YTHDC1Q96MU7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
YTHDC1Q96MU7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
YTHDC1Q96MU7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
YTHDC1Q96MU7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
YTHDC1Q96MU7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
YTHDC1Q96MU7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
YTHDC1Q96MU7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
YTHDC1Q96MU7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
YTHDC1Q96MU7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
YTHDC1Q96MU7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
YTHDC1Q96MU7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
YTHDC1Q96MU7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
YTHDC1Q96MU7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
YTHDC1Q96MU7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
YTHDC1Q96MU7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
YTHDC1Q96MU7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
YTHDC1Q96MU7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
YTHDC1Q96MU7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
YTHDC1Q96MU7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
YTHDC1Q96MU7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
YTHDC1Q96MU7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
YTHDC1Q96MU7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
YTHDC1Q96MU7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
YTHDC1Q96MU7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
YTHDC1Q96MU7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
YTHDC1Q96MU7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
YTHDC1Q96MU7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
YTHDC1Q96MU7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms