Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC138Q96M89 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC138Q96M89 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC138Q96M89 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC138Q96M89 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC138Q96M89 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC138Q96M89 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC138Q96M89 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC138Q96M89 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC138Q96M89 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC138Q96M89 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC138Q96M89 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC138Q96M89 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC138Q96M89 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC138Q96M89 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC138Q96M89 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC138Q96M89 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC138Q96M89 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC138Q96M89 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC138Q96M89 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC138Q96M89 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC138Q96M89 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC138Q96M89 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC138Q96M89 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC138Q96M89 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC138Q96M89 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC138Q96M89 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC138Q96M89 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC138Q96M89 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC138Q96M89 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC138Q96M89 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC138Q96M89 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC138Q96M89 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC138Q96M89 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC138Q96M89 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC138Q96M89 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC138Q96M89 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC138Q96M89 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC138Q96M89 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC138Q96M89 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC138Q96M89 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC138Q96M89 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC138Q96M89 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC138Q96M89 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC138Q96M89 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC138Q96M89 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC138Q96M89 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC138Q96M89 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC138Q96M89 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC138Q96M89 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC138Q96M89 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC138Q96M89 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC138Q96M89 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC138Q96M89 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC138Q96M89 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC138Q96M89 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC138Q96M89 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC138Q96M89 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC138Q96M89 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC138Q96M89 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC138Q96M89 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC138Q96M89 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC138Q96M89 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC138Q96M89 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC138Q96M89 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC138Q96M89 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC138Q96M89 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC138Q96M89 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC138Q96M89 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC138Q96M89 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC138Q96M89 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC138Q96M89 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC138Q96M89 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC138Q96M89 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC138Q96M89 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC138Q96M89 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC138Q96M89 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC138Q96M89 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC138Q96M89 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC138Q96M89 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC138Q96M89 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC138Q96M89 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC138Q96M89 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC138Q96M89 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC138Q96M89 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC138Q96M89 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC138Q96M89 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC138Q96M89 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC138Q96M89 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC138Q96M89 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC138Q96M89 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC138Q96M89 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC138Q96M89 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC138Q96M89 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC138Q96M89 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC138Q96M89 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC138Q96M89 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC138Q96M89 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC138Q96M89 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC138Q96M89 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms