Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKNOX2Q96KN3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKNOX2Q96KN3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKNOX2Q96KN3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKNOX2Q96KN3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKNOX2Q96KN3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKNOX2Q96KN3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKNOX2Q96KN3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKNOX2Q96KN3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKNOX2Q96KN3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKNOX2Q96KN3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKNOX2Q96KN3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKNOX2Q96KN3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKNOX2Q96KN3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKNOX2Q96KN3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKNOX2Q96KN3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKNOX2Q96KN3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PKNOX2Q96KN3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKNOX2Q96KN3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKNOX2Q96KN3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKNOX2Q96KN3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKNOX2Q96KN3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKNOX2Q96KN3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKNOX2Q96KN3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKNOX2Q96KN3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKNOX2Q96KN3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKNOX2Q96KN3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKNOX2Q96KN3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKNOX2Q96KN3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKNOX2Q96KN3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKNOX2Q96KN3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKNOX2Q96KN3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKNOX2Q96KN3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKNOX2Q96KN3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKNOX2Q96KN3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PKNOX2Q96KN3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKNOX2Q96KN3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKNOX2Q96KN3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKNOX2Q96KN3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKNOX2Q96KN3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKNOX2Q96KN3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKNOX2Q96KN3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PKNOX2Q96KN3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKNOX2Q96KN3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKNOX2Q96KN3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKNOX2Q96KN3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKNOX2Q96KN3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKNOX2Q96KN3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKNOX2Q96KN3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKNOX2Q96KN3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKNOX2Q96KN3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKNOX2Q96KN3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKNOX2Q96KN3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKNOX2Q96KN3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKNOX2Q96KN3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKNOX2Q96KN3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKNOX2Q96KN3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKNOX2Q96KN3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PKNOX2Q96KN3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKNOX2Q96KN3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKNOX2Q96KN3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKNOX2Q96KN3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKNOX2Q96KN3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKNOX2Q96KN3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKNOX2Q96KN3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKNOX2Q96KN3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKNOX2Q96KN3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKNOX2Q96KN3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKNOX2Q96KN3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKNOX2Q96KN3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKNOX2Q96KN3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PKNOX2Q96KN3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PKNOX2Q96KN3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PKNOX2Q96KN3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PKNOX2Q96KN3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PKNOX2Q96KN3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKNOX2Q96KN3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKNOX2Q96KN3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKNOX2Q96KN3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKNOX2Q96KN3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKNOX2Q96KN3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKNOX2Q96KN3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKNOX2Q96KN3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKNOX2Q96KN3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKNOX2Q96KN3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKNOX2Q96KN3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKNOX2Q96KN3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKNOX2Q96KN3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKNOX2Q96KN3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKNOX2Q96KN3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKNOX2Q96KN3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKNOX2Q96KN3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKNOX2Q96KN3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKNOX2Q96KN3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKNOX2Q96KN3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKNOX2Q96KN3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKNOX2Q96KN3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKNOX2Q96KN3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKNOX2Q96KN3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKNOX2Q96KN3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms