Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCHS1Q96JQ0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCHS1Q96JQ0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCHS1Q96JQ0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCHS1Q96JQ0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DCHS1Q96JQ0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DCHS1Q96JQ0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DCHS1Q96JQ0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
DCHS1Q96JQ0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCHS1Q96JQ0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DCHS1Q96JQ0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCHS1Q96JQ0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCHS1Q96JQ0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCHS1Q96JQ0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCHS1Q96JQ0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCHS1Q96JQ0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCHS1Q96JQ0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCHS1Q96JQ0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DCHS1Q96JQ0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCHS1Q96JQ0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCHS1Q96JQ0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCHS1Q96JQ0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCHS1Q96JQ0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCHS1Q96JQ0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCHS1Q96JQ0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCHS1Q96JQ0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCHS1Q96JQ0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DCHS1Q96JQ0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCHS1Q96JQ0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCHS1Q96JQ0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCHS1Q96JQ0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCHS1Q96JQ0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCHS1Q96JQ0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCHS1Q96JQ0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCHS1Q96JQ0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCHS1Q96JQ0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DCHS1Q96JQ0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DCHS1Q96JQ0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DCHS1Q96JQ0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCHS1Q96JQ0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCHS1Q96JQ0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCHS1Q96JQ0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCHS1Q96JQ0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCHS1Q96JQ0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCHS1Q96JQ0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCHS1Q96JQ0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCHS1Q96JQ0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCHS1Q96JQ0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCHS1Q96JQ0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCHS1Q96JQ0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCHS1Q96JQ0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCHS1Q96JQ0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCHS1Q96JQ0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCHS1Q96JQ0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCHS1Q96JQ0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCHS1Q96JQ0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCHS1Q96JQ0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCHS1Q96JQ0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCHS1Q96JQ0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCHS1Q96JQ0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCHS1Q96JQ0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCHS1Q96JQ0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCHS1Q96JQ0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCHS1Q96JQ0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DCHS1Q96JQ0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCHS1Q96JQ0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCHS1Q96JQ0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCHS1Q96JQ0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCHS1Q96JQ0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCHS1Q96JQ0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCHS1Q96JQ0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCHS1Q96JQ0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCHS1Q96JQ0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCHS1Q96JQ0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCHS1Q96JQ0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCHS1Q96JQ0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DCHS1Q96JQ0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCHS1Q96JQ0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCHS1Q96JQ0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCHS1Q96JQ0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCHS1Q96JQ0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DCHS1Q96JQ0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCHS1Q96JQ0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCHS1Q96JQ0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCHS1Q96JQ0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCHS1Q96JQ0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCHS1Q96JQ0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCHS1Q96JQ0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCHS1Q96JQ0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DCHS1Q96JQ0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DCHS1Q96JQ0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCHS1Q96JQ0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCHS1Q96JQ0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCHS1Q96JQ0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCHS1Q96JQ0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCHS1Q96JQ0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCHS1Q96JQ0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DCHS1Q96JQ0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms