Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HIC2Q96JB3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIC2Q96JB3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIC2Q96JB3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIC2Q96JB3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIC2Q96JB3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIC2Q96JB3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HIC2Q96JB3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIC2Q96JB3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIC2Q96JB3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIC2Q96JB3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HIC2Q96JB3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIC2Q96JB3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIC2Q96JB3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIC2Q96JB3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIC2Q96JB3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIC2Q96JB3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIC2Q96JB3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIC2Q96JB3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
HIC2Q96JB3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIC2Q96JB3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIC2Q96JB3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIC2Q96JB3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIC2Q96JB3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIC2Q96JB3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIC2Q96JB3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIC2Q96JB3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIC2Q96JB3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIC2Q96JB3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIC2Q96JB3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIC2Q96JB3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIC2Q96JB3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIC2Q96JB3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIC2Q96JB3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIC2Q96JB3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIC2Q96JB3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIC2Q96JB3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIC2Q96JB3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIC2Q96JB3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIC2Q96JB3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIC2Q96JB3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIC2Q96JB3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIC2Q96JB3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIC2Q96JB3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIC2Q96JB3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIC2Q96JB3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIC2Q96JB3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIC2Q96JB3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIC2Q96JB3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIC2Q96JB3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HIC2Q96JB3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIC2Q96JB3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HIC2Q96JB3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HIC2Q96JB3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIC2Q96JB3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIC2Q96JB3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIC2Q96JB3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIC2Q96JB3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms