Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW7

SEC22A, Vesicle-trafficking protein SEC22a, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22AQ96IW7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC22AQ96IW7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC22AQ96IW7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC22AQ96IW7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC22AQ96IW7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC22AQ96IW7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC22AQ96IW7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC22AQ96IW7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC22AQ96IW7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEC22AQ96IW7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEC22AQ96IW7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC22AQ96IW7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC22AQ96IW7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC22AQ96IW7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC22AQ96IW7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC22AQ96IW7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC22AQ96IW7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC22AQ96IW7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC22AQ96IW7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC22AQ96IW7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC22AQ96IW7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC22AQ96IW7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC22AQ96IW7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC22AQ96IW7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC22AQ96IW7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC22AQ96IW7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC22AQ96IW7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC22AQ96IW7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC22AQ96IW7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC22AQ96IW7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC22AQ96IW7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC22AQ96IW7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC22AQ96IW7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC22AQ96IW7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC22AQ96IW7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC22AQ96IW7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC22AQ96IW7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC22AQ96IW7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC22AQ96IW7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC22AQ96IW7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC22AQ96IW7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC22AQ96IW7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC22AQ96IW7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC22AQ96IW7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC22AQ96IW7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC22AQ96IW7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms