Protein–RNA interactions for Protein: Q96I45

TMEM141, Transmembrane protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM141Q96I45 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TMEM141Q96I45 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM141Q96I45 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms