Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCD1Q96GM5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCD1Q96GM5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCD1Q96GM5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCD1Q96GM5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCD1Q96GM5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCD1Q96GM5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCD1Q96GM5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMARCD1Q96GM5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCD1Q96GM5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCD1Q96GM5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCD1Q96GM5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCD1Q96GM5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCD1Q96GM5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCD1Q96GM5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCD1Q96GM5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCD1Q96GM5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCD1Q96GM5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCD1Q96GM5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCD1Q96GM5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCD1Q96GM5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCD1Q96GM5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCD1Q96GM5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCD1Q96GM5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCD1Q96GM5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCD1Q96GM5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCD1Q96GM5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCD1Q96GM5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCD1Q96GM5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCD1Q96GM5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCD1Q96GM5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCD1Q96GM5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCD1Q96GM5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCD1Q96GM5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCD1Q96GM5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCD1Q96GM5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCD1Q96GM5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCD1Q96GM5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCD1Q96GM5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCD1Q96GM5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCD1Q96GM5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCD1Q96GM5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCD1Q96GM5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCD1Q96GM5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCD1Q96GM5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCD1Q96GM5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCD1Q96GM5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCD1Q96GM5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCD1Q96GM5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCD1Q96GM5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCD1Q96GM5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCD1Q96GM5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCD1Q96GM5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCD1Q96GM5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCD1Q96GM5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCD1Q96GM5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCD1Q96GM5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms