Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT7

ASIC4, Acid-sensing ion channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC4Q96FT7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ASIC4Q96FT7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ASIC4Q96FT7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ASIC4Q96FT7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ASIC4Q96FT7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ASIC4Q96FT7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ASIC4Q96FT7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ASIC4Q96FT7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ASIC4Q96FT7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ASIC4Q96FT7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ASIC4Q96FT7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ASIC4Q96FT7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ASIC4Q96FT7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ASIC4Q96FT7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ASIC4Q96FT7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ASIC4Q96FT7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ASIC4Q96FT7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ASIC4Q96FT7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ASIC4Q96FT7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ASIC4Q96FT7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ASIC4Q96FT7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ASIC4Q96FT7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ASIC4Q96FT7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ASIC4Q96FT7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ASIC4Q96FT7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ASIC4Q96FT7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ASIC4Q96FT7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ASIC4Q96FT7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ASIC4Q96FT7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ASIC4Q96FT7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ASIC4Q96FT7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ASIC4Q96FT7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ASIC4Q96FT7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ASIC4Q96FT7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ASIC4Q96FT7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ASIC4Q96FT7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ASIC4Q96FT7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ASIC4Q96FT7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ASIC4Q96FT7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ASIC4Q96FT7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ASIC4Q96FT7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ASIC4Q96FT7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ASIC4Q96FT7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ASIC4Q96FT7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ASIC4Q96FT7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ASIC4Q96FT7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ASIC4Q96FT7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ASIC4Q96FT7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ASIC4Q96FT7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ASIC4Q96FT7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ASIC4Q96FT7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ASIC4Q96FT7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ASIC4Q96FT7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ASIC4Q96FT7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ASIC4Q96FT7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ASIC4Q96FT7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ASIC4Q96FT7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ASIC4Q96FT7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ASIC4Q96FT7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ASIC4Q96FT7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ASIC4Q96FT7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ASIC4Q96FT7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ASIC4Q96FT7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ASIC4Q96FT7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ASIC4Q96FT7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ASIC4Q96FT7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ASIC4Q96FT7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ASIC4Q96FT7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ASIC4Q96FT7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ASIC4Q96FT7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ASIC4Q96FT7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ASIC4Q96FT7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ASIC4Q96FT7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ASIC4Q96FT7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ASIC4Q96FT7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ASIC4Q96FT7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ASIC4Q96FT7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ASIC4Q96FT7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ASIC4Q96FT7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ASIC4Q96FT7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ASIC4Q96FT7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ASIC4Q96FT7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ASIC4Q96FT7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ASIC4Q96FT7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ASIC4Q96FT7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ASIC4Q96FT7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ASIC4Q96FT7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ASIC4Q96FT7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ASIC4Q96FT7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ASIC4Q96FT7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ASIC4Q96FT7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ASIC4Q96FT7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ASIC4Q96FT7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ASIC4Q96FT7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ASIC4Q96FT7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ASIC4Q96FT7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ASIC4Q96FT7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ASIC4Q96FT7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ASIC4Q96FT7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ASIC4Q96FT7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms