Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW5

TUBGCP3, Gamma-tubulin complex component 3, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP3Q96CW5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBGCP3Q96CW5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBGCP3Q96CW5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBGCP3Q96CW5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBGCP3Q96CW5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBGCP3Q96CW5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBGCP3Q96CW5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBGCP3Q96CW5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBGCP3Q96CW5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBGCP3Q96CW5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBGCP3Q96CW5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBGCP3Q96CW5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBGCP3Q96CW5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBGCP3Q96CW5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBGCP3Q96CW5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBGCP3Q96CW5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBGCP3Q96CW5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBGCP3Q96CW5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBGCP3Q96CW5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBGCP3Q96CW5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBGCP3Q96CW5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBGCP3Q96CW5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBGCP3Q96CW5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBGCP3Q96CW5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBGCP3Q96CW5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBGCP3Q96CW5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBGCP3Q96CW5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBGCP3Q96CW5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBGCP3Q96CW5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBGCP3Q96CW5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBGCP3Q96CW5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBGCP3Q96CW5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP3Q96CW5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP3Q96CW5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP3Q96CW5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP3Q96CW5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP3Q96CW5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP3Q96CW5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP3Q96CW5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP3Q96CW5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBGCP3Q96CW5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBGCP3Q96CW5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP3Q96CW5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP3Q96CW5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP3Q96CW5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP3Q96CW5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP3Q96CW5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP3Q96CW5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBGCP3Q96CW5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBGCP3Q96CW5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBGCP3Q96CW5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBGCP3Q96CW5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBGCP3Q96CW5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBGCP3Q96CW5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBGCP3Q96CW5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBGCP3Q96CW5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP3Q96CW5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP3Q96CW5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP3Q96CW5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP3Q96CW5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBGCP3Q96CW5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBGCP3Q96CW5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TUBGCP3Q96CW5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TUBGCP3Q96CW5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TUBGCP3Q96CW5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP3Q96CW5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP3Q96CW5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP3Q96CW5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP3Q96CW5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP3Q96CW5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP3Q96CW5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP3Q96CW5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP3Q96CW5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP3Q96CW5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP3Q96CW5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP3Q96CW5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP3Q96CW5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP3Q96CW5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP3Q96CW5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP3Q96CW5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP3Q96CW5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP3Q96CW5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP3Q96CW5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP3Q96CW5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBGCP3Q96CW5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBGCP3Q96CW5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBGCP3Q96CW5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBGCP3Q96CW5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBGCP3Q96CW5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBGCP3Q96CW5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBGCP3Q96CW5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBGCP3Q96CW5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBGCP3Q96CW5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBGCP3Q96CW5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBGCP3Q96CW5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBGCP3Q96CW5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBGCP3Q96CW5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBGCP3Q96CW5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBGCP3Q96CW5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBGCP3Q96CW5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms