Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHMP4CQ96CF2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHMP4CQ96CF2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHMP4CQ96CF2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHMP4CQ96CF2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHMP4CQ96CF2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CHMP4CQ96CF2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHMP4CQ96CF2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHMP4CQ96CF2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHMP4CQ96CF2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHMP4CQ96CF2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHMP4CQ96CF2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHMP4CQ96CF2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHMP4CQ96CF2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHMP4CQ96CF2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHMP4CQ96CF2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHMP4CQ96CF2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHMP4CQ96CF2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHMP4CQ96CF2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHMP4CQ96CF2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CHMP4CQ96CF2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CHMP4CQ96CF2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHMP4CQ96CF2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHMP4CQ96CF2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHMP4CQ96CF2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHMP4CQ96CF2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHMP4CQ96CF2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHMP4CQ96CF2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHMP4CQ96CF2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHMP4CQ96CF2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHMP4CQ96CF2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHMP4CQ96CF2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHMP4CQ96CF2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHMP4CQ96CF2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHMP4CQ96CF2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHMP4CQ96CF2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHMP4CQ96CF2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHMP4CQ96CF2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CHMP4CQ96CF2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHMP4CQ96CF2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHMP4CQ96CF2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHMP4CQ96CF2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHMP4CQ96CF2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHMP4CQ96CF2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHMP4CQ96CF2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHMP4CQ96CF2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHMP4CQ96CF2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHMP4CQ96CF2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHMP4CQ96CF2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHMP4CQ96CF2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHMP4CQ96CF2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHMP4CQ96CF2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHMP4CQ96CF2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CHMP4CQ96CF2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHMP4CQ96CF2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHMP4CQ96CF2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHMP4CQ96CF2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CHMP4CQ96CF2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHMP4CQ96CF2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHMP4CQ96CF2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHMP4CQ96CF2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHMP4CQ96CF2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHMP4CQ96CF2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CHMP4CQ96CF2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHMP4CQ96CF2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHMP4CQ96CF2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHMP4CQ96CF2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHMP4CQ96CF2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHMP4CQ96CF2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHMP4CQ96CF2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHMP4CQ96CF2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CHMP4CQ96CF2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHMP4CQ96CF2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHMP4CQ96CF2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHMP4CQ96CF2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHMP4CQ96CF2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHMP4CQ96CF2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHMP4CQ96CF2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHMP4CQ96CF2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHMP4CQ96CF2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMP4CQ96CF2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMP4CQ96CF2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMP4CQ96CF2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMP4CQ96CF2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMP4CQ96CF2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMP4CQ96CF2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHMP4CQ96CF2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHMP4CQ96CF2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHMP4CQ96CF2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHMP4CQ96CF2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CHMP4CQ96CF2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHMP4CQ96CF2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHMP4CQ96CF2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHMP4CQ96CF2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHMP4CQ96CF2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CHMP4CQ96CF2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CHMP4CQ96CF2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHMP4CQ96CF2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CHMP4CQ96CF2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHMP4CQ96CF2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms