Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT1

C3orf49, Putative uncharacterized protein C3orf49, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf49Q96BT1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C3orf49Q96BT1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C3orf49Q96BT1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C3orf49Q96BT1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C3orf49Q96BT1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C3orf49Q96BT1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C3orf49Q96BT1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C3orf49Q96BT1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C3orf49Q96BT1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C3orf49Q96BT1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C3orf49Q96BT1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C3orf49Q96BT1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C3orf49Q96BT1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C3orf49Q96BT1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C3orf49Q96BT1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C3orf49Q96BT1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C3orf49Q96BT1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C3orf49Q96BT1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C3orf49Q96BT1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C3orf49Q96BT1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
C3orf49Q96BT1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C3orf49Q96BT1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C3orf49Q96BT1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C3orf49Q96BT1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C3orf49Q96BT1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C3orf49Q96BT1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C3orf49Q96BT1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C3orf49Q96BT1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C3orf49Q96BT1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C3orf49Q96BT1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C3orf49Q96BT1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C3orf49Q96BT1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C3orf49Q96BT1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C3orf49Q96BT1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C3orf49Q96BT1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C3orf49Q96BT1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C3orf49Q96BT1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C3orf49Q96BT1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C3orf49Q96BT1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C3orf49Q96BT1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C3orf49Q96BT1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C3orf49Q96BT1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C3orf49Q96BT1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C3orf49Q96BT1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C3orf49Q96BT1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C3orf49Q96BT1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C3orf49Q96BT1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C3orf49Q96BT1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C3orf49Q96BT1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C3orf49Q96BT1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C3orf49Q96BT1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C3orf49Q96BT1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C3orf49Q96BT1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C3orf49Q96BT1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C3orf49Q96BT1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C3orf49Q96BT1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms