Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
TRIM52Q96A61 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
TRIM52Q96A61 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
TRIM52Q96A61 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
TRIM52Q96A61 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
TRIM52Q96A61 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
TRIM52Q96A61 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
TRIM52Q96A61 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
TRIM52Q96A61 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
TRIM52Q96A61 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
TRIM52Q96A61 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
TRIM52Q96A61 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
TRIM52Q96A61 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
TRIM52Q96A61 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
TRIM52Q96A61 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
TRIM52Q96A61 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
TRIM52Q96A61 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
TRIM52Q96A61 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
TRIM52Q96A61 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
TRIM52Q96A61 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
TRIM52Q96A61 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
TRIM52Q96A61 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
TRIM52Q96A61 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TRIM52Q96A61 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
TRIM52Q96A61 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
TRIM52Q96A61 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
TRIM52Q96A61 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
TRIM52Q96A61 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
TRIM52Q96A61 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TRIM52Q96A61 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
TRIM52Q96A61 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TRIM52Q96A61 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TRIM52Q96A61 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TRIM52Q96A61 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TRIM52Q96A61 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
TRIM52Q96A61 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
TRIM52Q96A61 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
TRIM52Q96A61 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC36.46■■■■□ 3.43
TRIM52Q96A61 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TRIM52Q96A61 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TRIM52Q96A61 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TRIM52Q96A61 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
TRIM52Q96A61 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TRIM52Q96A61 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TRIM52Q96A61 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TRIM52Q96A61 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
TRIM52Q96A61 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TRIM52Q96A61 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TRIM52Q96A61 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TRIM52Q96A61 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
TRIM52Q96A61 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TRIM52Q96A61 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TRIM52Q96A61 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TRIM52Q96A61 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TRIM52Q96A61 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TRIM52Q96A61 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TRIM52Q96A61 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
TRIM52Q96A61 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TRIM52Q96A61 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TRIM52Q96A61 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TRIM52Q96A61 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TRIM52Q96A61 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
TRIM52Q96A61 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TRIM52Q96A61 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TRIM52Q96A61 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TRIM52Q96A61 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TRIM52Q96A61 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TRIM52Q96A61 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
TRIM52Q96A61 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TRIM52Q96A61 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TRIM52Q96A61 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
TRIM52Q96A61 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
TRIM52Q96A61 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
TRIM52Q96A61 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
TRIM52Q96A61 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
TRIM52Q96A61 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TRIM52Q96A61 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TRIM52Q96A61 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TRIM52Q96A61 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TRIM52Q96A61 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TRIM52Q96A61 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TRIM52Q96A61 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
TRIM52Q96A61 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TRIM52Q96A61 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TRIM52Q96A61 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TRIM52Q96A61 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TRIM52Q96A61 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TRIM52Q96A61 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
TRIM52Q96A61 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
TRIM52Q96A61 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
TRIM52Q96A61 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
TRIM52Q96A61 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
TRIM52Q96A61 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
TRIM52Q96A61 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TRIM52Q96A61 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TRIM52Q96A61 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TRIM52Q96A61 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TRIM52Q96A61 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
TRIM52Q96A61 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
TRIM52Q96A61 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms