Protein–RNA interactions for Protein: Q96A49

SYAP1, Synapse-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYAP1Q96A49 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYAP1Q96A49 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYAP1Q96A49 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYAP1Q96A49 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYAP1Q96A49 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYAP1Q96A49 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SYAP1Q96A49 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYAP1Q96A49 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYAP1Q96A49 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYAP1Q96A49 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYAP1Q96A49 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SYAP1Q96A49 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYAP1Q96A49 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYAP1Q96A49 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYAP1Q96A49 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYAP1Q96A49 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYAP1Q96A49 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYAP1Q96A49 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYAP1Q96A49 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYAP1Q96A49 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYAP1Q96A49 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYAP1Q96A49 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SYAP1Q96A49 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SYAP1Q96A49 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYAP1Q96A49 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYAP1Q96A49 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYAP1Q96A49 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYAP1Q96A49 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYAP1Q96A49 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYAP1Q96A49 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYAP1Q96A49 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYAP1Q96A49 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYAP1Q96A49 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYAP1Q96A49 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYAP1Q96A49 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYAP1Q96A49 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYAP1Q96A49 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYAP1Q96A49 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYAP1Q96A49 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYAP1Q96A49 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYAP1Q96A49 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYAP1Q96A49 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYAP1Q96A49 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYAP1Q96A49 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYAP1Q96A49 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYAP1Q96A49 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYAP1Q96A49 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYAP1Q96A49 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYAP1Q96A49 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYAP1Q96A49 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYAP1Q96A49 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYAP1Q96A49 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYAP1Q96A49 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYAP1Q96A49 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SYAP1Q96A49 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYAP1Q96A49 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYAP1Q96A49 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYAP1Q96A49 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYAP1Q96A49 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYAP1Q96A49 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYAP1Q96A49 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYAP1Q96A49 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYAP1Q96A49 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYAP1Q96A49 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYAP1Q96A49 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYAP1Q96A49 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SYAP1Q96A49 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYAP1Q96A49 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SYAP1Q96A49 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SYAP1Q96A49 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SYAP1Q96A49 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYAP1Q96A49 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SYAP1Q96A49 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYAP1Q96A49 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYAP1Q96A49 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYAP1Q96A49 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYAP1Q96A49 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYAP1Q96A49 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SYAP1Q96A49 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYAP1Q96A49 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYAP1Q96A49 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYAP1Q96A49 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SYAP1Q96A49 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYAP1Q96A49 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYAP1Q96A49 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYAP1Q96A49 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYAP1Q96A49 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYAP1Q96A49 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYAP1Q96A49 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SYAP1Q96A49 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYAP1Q96A49 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYAP1Q96A49 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYAP1Q96A49 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYAP1Q96A49 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYAP1Q96A49 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYAP1Q96A49 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYAP1Q96A49 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYAP1Q96A49 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYAP1Q96A49 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYAP1Q96A49 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms