Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HPS3Q969F9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HPS3Q969F9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HPS3Q969F9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
HPS3Q969F9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HPS3Q969F9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HPS3Q969F9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HPS3Q969F9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HPS3Q969F9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HPS3Q969F9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HPS3Q969F9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HPS3Q969F9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HPS3Q969F9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HPS3Q969F9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HPS3Q969F9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HPS3Q969F9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HPS3Q969F9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HPS3Q969F9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HPS3Q969F9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HPS3Q969F9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HPS3Q969F9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HPS3Q969F9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HPS3Q969F9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HPS3Q969F9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HPS3Q969F9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HPS3Q969F9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HPS3Q969F9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HPS3Q969F9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HPS3Q969F9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HPS3Q969F9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HPS3Q969F9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HPS3Q969F9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HPS3Q969F9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HPS3Q969F9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HPS3Q969F9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HPS3Q969F9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HPS3Q969F9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HPS3Q969F9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HPS3Q969F9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HPS3Q969F9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HPS3Q969F9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HPS3Q969F9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HPS3Q969F9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HPS3Q969F9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HPS3Q969F9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HPS3Q969F9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HPS3Q969F9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HPS3Q969F9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HPS3Q969F9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HPS3Q969F9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HPS3Q969F9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HPS3Q969F9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HPS3Q969F9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HPS3Q969F9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HPS3Q969F9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
HPS3Q969F9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HPS3Q969F9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HPS3Q969F9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HPS3Q969F9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HPS3Q969F9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HPS3Q969F9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HPS3Q969F9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HPS3Q969F9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HPS3Q969F9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HPS3Q969F9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HPS3Q969F9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HPS3Q969F9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HPS3Q969F9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HPS3Q969F9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HPS3Q969F9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HPS3Q969F9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HPS3Q969F9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HPS3Q969F9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HPS3Q969F9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HPS3Q969F9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HPS3Q969F9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HPS3Q969F9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HPS3Q969F9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HPS3Q969F9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HPS3Q969F9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HPS3Q969F9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HPS3Q969F9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HPS3Q969F9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HPS3Q969F9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
HPS3Q969F9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HPS3Q969F9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HPS3Q969F9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HPS3Q969F9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HPS3Q969F9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HPS3Q969F9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HPS3Q969F9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HPS3Q969F9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HPS3Q969F9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HPS3Q969F9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HPS3Q969F9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HPS3Q969F9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HPS3Q969F9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HPS3Q969F9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HPS3Q969F9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HPS3Q969F9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms