Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
NEO1Q92859 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
NEO1Q92859 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
NEO1Q92859 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
NEO1Q92859 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC38.03■■■■□ 3.68
NEO1Q92859 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
NEO1Q92859 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
NEO1Q92859 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
NEO1Q92859 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
NEO1Q92859 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
NEO1Q92859 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
NEO1Q92859 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
NEO1Q92859 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
NEO1Q92859 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
NEO1Q92859 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
NEO1Q92859 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
NEO1Q92859 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
NEO1Q92859 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
NEO1Q92859 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
NEO1Q92859 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
NEO1Q92859 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
NEO1Q92859 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
NEO1Q92859 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
NEO1Q92859 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
NEO1Q92859 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
NEO1Q92859 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
NEO1Q92859 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
NEO1Q92859 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
NEO1Q92859 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
NEO1Q92859 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
NEO1Q92859 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
NEO1Q92859 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
NEO1Q92859 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
NEO1Q92859 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
NEO1Q92859 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
NEO1Q92859 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
NEO1Q92859 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
NEO1Q92859 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
NEO1Q92859 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
NEO1Q92859 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
NEO1Q92859 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
NEO1Q92859 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
NEO1Q92859 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
NEO1Q92859 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
NEO1Q92859 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
NEO1Q92859 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
NEO1Q92859 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
NEO1Q92859 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
NEO1Q92859 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
NEO1Q92859 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
NEO1Q92859 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
NEO1Q92859 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
NEO1Q92859 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
NEO1Q92859 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NEO1Q92859 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
NEO1Q92859 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
NEO1Q92859 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
NEO1Q92859 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
NEO1Q92859 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
NEO1Q92859 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
NEO1Q92859 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
NEO1Q92859 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
NEO1Q92859 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
NEO1Q92859 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
NEO1Q92859 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
NEO1Q92859 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
NEO1Q92859 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
NEO1Q92859 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NEO1Q92859 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
NEO1Q92859 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
NEO1Q92859 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
NEO1Q92859 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
NEO1Q92859 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
NEO1Q92859 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
NEO1Q92859 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
NEO1Q92859 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
NEO1Q92859 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
NEO1Q92859 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
NEO1Q92859 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
NEO1Q92859 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NEO1Q92859 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
NEO1Q92859 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
NEO1Q92859 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NEO1Q92859 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
NEO1Q92859 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
NEO1Q92859 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
NEO1Q92859 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
NEO1Q92859 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
NEO1Q92859 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
NEO1Q92859 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
NEO1Q92859 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
NEO1Q92859 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
NEO1Q92859 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
NEO1Q92859 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC37.76■■■■□ 3.63
NEO1Q92859 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
NEO1Q92859 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
NEO1Q92859 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
NEO1Q92859 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NEO1Q92859 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NEO1Q92859 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms