Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA4DQ92854 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA4DQ92854 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA4DQ92854 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA4DQ92854 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA4DQ92854 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA4DQ92854 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA4DQ92854 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA4DQ92854 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA4DQ92854 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA4DQ92854 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA4DQ92854 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA4DQ92854 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEMA4DQ92854 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEMA4DQ92854 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEMA4DQ92854 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SEMA4DQ92854 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEMA4DQ92854 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SEMA4DQ92854 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SEMA4DQ92854 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA4DQ92854 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA4DQ92854 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA4DQ92854 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA4DQ92854 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA4DQ92854 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA4DQ92854 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA4DQ92854 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA4DQ92854 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA4DQ92854 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA4DQ92854 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA4DQ92854 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA4DQ92854 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA4DQ92854 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA4DQ92854 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA4DQ92854 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA4DQ92854 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA4DQ92854 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEMA4DQ92854 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEMA4DQ92854 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEMA4DQ92854 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEMA4DQ92854 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEMA4DQ92854 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA4DQ92854 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA4DQ92854 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA4DQ92854 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEMA4DQ92854 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEMA4DQ92854 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEMA4DQ92854 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEMA4DQ92854 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SEMA4DQ92854 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEMA4DQ92854 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEMA4DQ92854 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SEMA4DQ92854 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEMA4DQ92854 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA4DQ92854 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA4DQ92854 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA4DQ92854 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA4DQ92854 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA4DQ92854 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA4DQ92854 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA4DQ92854 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA4DQ92854 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA4DQ92854 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA4DQ92854 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA4DQ92854 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA4DQ92854 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA4DQ92854 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEMA4DQ92854 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEMA4DQ92854 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEMA4DQ92854 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEMA4DQ92854 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEMA4DQ92854 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEMA4DQ92854 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEMA4DQ92854 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SEMA4DQ92854 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEMA4DQ92854 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEMA4DQ92854 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SEMA4DQ92854 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEMA4DQ92854 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEMA4DQ92854 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEMA4DQ92854 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SEMA4DQ92854 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEMA4DQ92854 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEMA4DQ92854 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEMA4DQ92854 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEMA4DQ92854 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEMA4DQ92854 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEMA4DQ92854 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEMA4DQ92854 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEMA4DQ92854 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEMA4DQ92854 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEMA4DQ92854 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SEMA4DQ92854 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SEMA4DQ92854 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEMA4DQ92854 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEMA4DQ92854 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEMA4DQ92854 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEMA4DQ92854 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEMA4DQ92854 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEMA4DQ92854 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms