Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKL2Q92772 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDKL2Q92772 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDKL2Q92772 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDKL2Q92772 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKL2Q92772 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKL2Q92772 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKL2Q92772 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKL2Q92772 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKL2Q92772 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKL2Q92772 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKL2Q92772 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKL2Q92772 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKL2Q92772 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL2Q92772 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL2Q92772 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL2Q92772 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL2Q92772 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKL2Q92772 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKL2Q92772 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKL2Q92772 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKL2Q92772 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKL2Q92772 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKL2Q92772 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKL2Q92772 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKL2Q92772 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKL2Q92772 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKL2Q92772 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKL2Q92772 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKL2Q92772 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKL2Q92772 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKL2Q92772 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKL2Q92772 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKL2Q92772 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKL2Q92772 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKL2Q92772 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKL2Q92772 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKL2Q92772 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKL2Q92772 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKL2Q92772 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKL2Q92772 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKL2Q92772 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKL2Q92772 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKL2Q92772 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKL2Q92772 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKL2Q92772 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKL2Q92772 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKL2Q92772 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKL2Q92772 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKL2Q92772 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKL2Q92772 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKL2Q92772 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKL2Q92772 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKL2Q92772 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKL2Q92772 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKL2Q92772 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms