Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
UBXN4Q92575 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
UBXN4Q92575 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
UBXN4Q92575 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBXN4Q92575 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBXN4Q92575 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBXN4Q92575 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBXN4Q92575 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBXN4Q92575 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBXN4Q92575 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBXN4Q92575 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBXN4Q92575 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBXN4Q92575 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBXN4Q92575 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBXN4Q92575 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBXN4Q92575 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBXN4Q92575 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
UBXN4Q92575 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBXN4Q92575 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBXN4Q92575 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBXN4Q92575 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBXN4Q92575 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBXN4Q92575 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBXN4Q92575 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBXN4Q92575 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBXN4Q92575 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBXN4Q92575 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBXN4Q92575 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBXN4Q92575 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBXN4Q92575 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
UBXN4Q92575 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBXN4Q92575 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBXN4Q92575 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBXN4Q92575 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBXN4Q92575 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBXN4Q92575 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBXN4Q92575 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
UBXN4Q92575 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBXN4Q92575 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBXN4Q92575 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBXN4Q92575 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBXN4Q92575 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBXN4Q92575 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBXN4Q92575 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBXN4Q92575 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBXN4Q92575 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
UBXN4Q92575 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBXN4Q92575 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBXN4Q92575 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBXN4Q92575 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms