Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC40.01■■■■■ 4
CTTNBP2Q8WZ74 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC40.01■■■■■ 4
CTTNBP2Q8WZ74 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC40.01■■■■■ 4
CTTNBP2Q8WZ74 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
CTTNBP2Q8WZ74 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
CTTNBP2Q8WZ74 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC40■■■■□ 3.99
CTTNBP2Q8WZ74 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
CTTNBP2Q8WZ74 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CTTNBP2Q8WZ74 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CTTNBP2Q8WZ74 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CTTNBP2Q8WZ74 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CTTNBP2Q8WZ74 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CTTNBP2Q8WZ74 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
CTTNBP2Q8WZ74 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CTTNBP2Q8WZ74 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
CTTNBP2Q8WZ74 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CTTNBP2Q8WZ74 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
CTTNBP2Q8WZ74 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
CTTNBP2Q8WZ74 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
CTTNBP2Q8WZ74 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
CTTNBP2Q8WZ74 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
CTTNBP2Q8WZ74 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
CTTNBP2Q8WZ74 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
CTTNBP2Q8WZ74 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
CTTNBP2Q8WZ74 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
CTTNBP2Q8WZ74 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.92■■■■□ 3.98
CTTNBP2Q8WZ74 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
CTTNBP2Q8WZ74 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
CTTNBP2Q8WZ74 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC39.92■■■■□ 3.98
CTTNBP2Q8WZ74 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
CTTNBP2Q8WZ74 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC39.91■■■■□ 3.98
CTTNBP2Q8WZ74 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
CTTNBP2Q8WZ74 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
CTTNBP2Q8WZ74 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
CTTNBP2Q8WZ74 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
CTTNBP2Q8WZ74 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
CTTNBP2Q8WZ74 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
CTTNBP2Q8WZ74 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC39.89■■■■□ 3.98
CTTNBP2Q8WZ74 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
CTTNBP2Q8WZ74 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
CTTNBP2Q8WZ74 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC39.87■■■■□ 3.97
CTTNBP2Q8WZ74 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
CTTNBP2Q8WZ74 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
CTTNBP2Q8WZ74 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC39.86■■■■□ 3.97
CTTNBP2Q8WZ74 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
CTTNBP2Q8WZ74 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
CTTNBP2Q8WZ74 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
CTTNBP2Q8WZ74 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
CTTNBP2Q8WZ74 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
CTTNBP2Q8WZ74 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
CTTNBP2Q8WZ74 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
CTTNBP2Q8WZ74 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
CTTNBP2Q8WZ74 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
CTTNBP2Q8WZ74 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
CTTNBP2Q8WZ74 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
CTTNBP2Q8WZ74 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
CTTNBP2Q8WZ74 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
CTTNBP2Q8WZ74 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
CTTNBP2Q8WZ74 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
CTTNBP2Q8WZ74 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.96
CTTNBP2Q8WZ74 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.96
CTTNBP2Q8WZ74 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC39.82■■■■□ 3.96
CTTNBP2Q8WZ74 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
CTTNBP2Q8WZ74 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
CTTNBP2Q8WZ74 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
CTTNBP2Q8WZ74 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
CTTNBP2Q8WZ74 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
CTTNBP2Q8WZ74 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
CTTNBP2Q8WZ74 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
CTTNBP2Q8WZ74 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
CTTNBP2Q8WZ74 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
CTTNBP2Q8WZ74 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
CTTNBP2Q8WZ74 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
CTTNBP2Q8WZ74 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
CTTNBP2Q8WZ74 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
CTTNBP2Q8WZ74 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
CTTNBP2Q8WZ74 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
CTTNBP2Q8WZ74 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC39.79■■■■□ 3.96
CTTNBP2Q8WZ74 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
CTTNBP2Q8WZ74 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC39.77■■■■□ 3.96
CTTNBP2Q8WZ74 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
CTTNBP2Q8WZ74 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
CTTNBP2Q8WZ74 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC39.75■■■■□ 3.95
CTTNBP2Q8WZ74 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC39.75■■■■□ 3.95
CTTNBP2Q8WZ74 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
CTTNBP2Q8WZ74 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
CTTNBP2Q8WZ74 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
CTTNBP2Q8WZ74 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.74■■■■□ 3.95
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.73■■■■□ 3.95
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
CTTNBP2Q8WZ74 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
CTTNBP2Q8WZ74 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
CTTNBP2Q8WZ74 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
CTTNBP2Q8WZ74 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
CTTNBP2Q8WZ74 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
CTTNBP2Q8WZ74 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms