Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX39

LCN9, Epididymal-specific lipocalin-9, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN9Q8WX39 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LCN9Q8WX39 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LCN9Q8WX39 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LCN9Q8WX39 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCN9Q8WX39 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCN9Q8WX39 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCN9Q8WX39 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCN9Q8WX39 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCN9Q8WX39 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCN9Q8WX39 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCN9Q8WX39 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LCN9Q8WX39 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCN9Q8WX39 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCN9Q8WX39 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LCN9Q8WX39 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LCN9Q8WX39 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LCN9Q8WX39 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LCN9Q8WX39 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LCN9Q8WX39 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LCN9Q8WX39 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LCN9Q8WX39 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LCN9Q8WX39 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LCN9Q8WX39 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LCN9Q8WX39 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LCN9Q8WX39 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCN9Q8WX39 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCN9Q8WX39 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCN9Q8WX39 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCN9Q8WX39 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCN9Q8WX39 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCN9Q8WX39 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCN9Q8WX39 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCN9Q8WX39 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LCN9Q8WX39 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCN9Q8WX39 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCN9Q8WX39 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCN9Q8WX39 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCN9Q8WX39 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LCN9Q8WX39 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LCN9Q8WX39 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LCN9Q8WX39 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LCN9Q8WX39 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LCN9Q8WX39 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LCN9Q8WX39 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LCN9Q8WX39 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LCN9Q8WX39 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
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LCN9Q8WX39 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
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LCN9Q8WX39 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCN9Q8WX39 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
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LCN9Q8WX39 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
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LCN9Q8WX39 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
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LCN9Q8WX39 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCN9Q8WX39 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCN9Q8WX39 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
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LCN9Q8WX39 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
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LCN9Q8WX39 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
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LCN9Q8WX39 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCN9Q8WX39 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
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LCN9Q8WX39 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LCN9Q8WX39 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCN9Q8WX39 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCN9Q8WX39 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCN9Q8WX39 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCN9Q8WX39 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCN9Q8WX39 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCN9Q8WX39 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCN9Q8WX39 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCN9Q8WX39 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCN9Q8WX39 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCN9Q8WX39 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LCN9Q8WX39 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCN9Q8WX39 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCN9Q8WX39 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCN9Q8WX39 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCN9Q8WX39 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCN9Q8WX39 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LCN9Q8WX39 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCN9Q8WX39 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCN9Q8WX39 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCN9Q8WX39 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCN9Q8WX39 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
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