Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSMEM1Q8WWF3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSMEM1Q8WWF3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSMEM1Q8WWF3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSMEM1Q8WWF3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSMEM1Q8WWF3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSMEM1Q8WWF3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSMEM1Q8WWF3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSMEM1Q8WWF3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSMEM1Q8WWF3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSMEM1Q8WWF3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSMEM1Q8WWF3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSMEM1Q8WWF3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSMEM1Q8WWF3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSMEM1Q8WWF3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSMEM1Q8WWF3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSMEM1Q8WWF3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSMEM1Q8WWF3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSMEM1Q8WWF3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSMEM1Q8WWF3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SSMEM1Q8WWF3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SSMEM1Q8WWF3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSMEM1Q8WWF3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSMEM1Q8WWF3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSMEM1Q8WWF3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSMEM1Q8WWF3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSMEM1Q8WWF3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSMEM1Q8WWF3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSMEM1Q8WWF3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSMEM1Q8WWF3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSMEM1Q8WWF3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SSMEM1Q8WWF3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSMEM1Q8WWF3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSMEM1Q8WWF3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSMEM1Q8WWF3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSMEM1Q8WWF3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSMEM1Q8WWF3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSMEM1Q8WWF3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSMEM1Q8WWF3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSMEM1Q8WWF3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms