Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVB6

CHTF18, Chromosome transmission fidelity protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18Q8WVB6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHTF18Q8WVB6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHTF18Q8WVB6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHTF18Q8WVB6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHTF18Q8WVB6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHTF18Q8WVB6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHTF18Q8WVB6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHTF18Q8WVB6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHTF18Q8WVB6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHTF18Q8WVB6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHTF18Q8WVB6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHTF18Q8WVB6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHTF18Q8WVB6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHTF18Q8WVB6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHTF18Q8WVB6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CHTF18Q8WVB6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHTF18Q8WVB6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHTF18Q8WVB6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHTF18Q8WVB6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHTF18Q8WVB6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHTF18Q8WVB6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHTF18Q8WVB6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHTF18Q8WVB6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHTF18Q8WVB6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHTF18Q8WVB6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHTF18Q8WVB6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHTF18Q8WVB6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHTF18Q8WVB6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHTF18Q8WVB6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHTF18Q8WVB6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHTF18Q8WVB6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHTF18Q8WVB6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHTF18Q8WVB6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHTF18Q8WVB6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHTF18Q8WVB6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHTF18Q8WVB6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHTF18Q8WVB6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHTF18Q8WVB6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHTF18Q8WVB6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHTF18Q8WVB6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHTF18Q8WVB6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHTF18Q8WVB6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHTF18Q8WVB6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHTF18Q8WVB6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHTF18Q8WVB6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHTF18Q8WVB6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHTF18Q8WVB6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHTF18Q8WVB6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHTF18Q8WVB6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHTF18Q8WVB6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHTF18Q8WVB6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHTF18Q8WVB6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHTF18Q8WVB6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHTF18Q8WVB6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHTF18Q8WVB6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHTF18Q8WVB6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHTF18Q8WVB6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHTF18Q8WVB6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHTF18Q8WVB6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHTF18Q8WVB6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHTF18Q8WVB6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHTF18Q8WVB6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHTF18Q8WVB6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHTF18Q8WVB6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHTF18Q8WVB6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHTF18Q8WVB6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHTF18Q8WVB6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHTF18Q8WVB6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHTF18Q8WVB6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHTF18Q8WVB6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHTF18Q8WVB6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHTF18Q8WVB6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHTF18Q8WVB6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHTF18Q8WVB6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHTF18Q8WVB6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHTF18Q8WVB6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHTF18Q8WVB6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CHTF18Q8WVB6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHTF18Q8WVB6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHTF18Q8WVB6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHTF18Q8WVB6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHTF18Q8WVB6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHTF18Q8WVB6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHTF18Q8WVB6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHTF18Q8WVB6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHTF18Q8WVB6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHTF18Q8WVB6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHTF18Q8WVB6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHTF18Q8WVB6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHTF18Q8WVB6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHTF18Q8WVB6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHTF18Q8WVB6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHTF18Q8WVB6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHTF18Q8WVB6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHTF18Q8WVB6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHTF18Q8WVB6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHTF18Q8WVB6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHTF18Q8WVB6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHTF18Q8WVB6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHTF18Q8WVB6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms