Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF40

FNIP1, Folliculin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNIP1Q8TF40 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FNIP1Q8TF40 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FNIP1Q8TF40 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FNIP1Q8TF40 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FNIP1Q8TF40 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FNIP1Q8TF40 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FNIP1Q8TF40 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FNIP1Q8TF40 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FNIP1Q8TF40 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FNIP1Q8TF40 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FNIP1Q8TF40 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FNIP1Q8TF40 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FNIP1Q8TF40 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FNIP1Q8TF40 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FNIP1Q8TF40 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FNIP1Q8TF40 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FNIP1Q8TF40 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FNIP1Q8TF40 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FNIP1Q8TF40 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FNIP1Q8TF40 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FNIP1Q8TF40 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FNIP1Q8TF40 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FNIP1Q8TF40 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FNIP1Q8TF40 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FNIP1Q8TF40 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FNIP1Q8TF40 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FNIP1Q8TF40 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FNIP1Q8TF40 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FNIP1Q8TF40 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FNIP1Q8TF40 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FNIP1Q8TF40 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FNIP1Q8TF40 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FNIP1Q8TF40 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FNIP1Q8TF40 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FNIP1Q8TF40 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FNIP1Q8TF40 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FNIP1Q8TF40 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FNIP1Q8TF40 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FNIP1Q8TF40 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FNIP1Q8TF40 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FNIP1Q8TF40 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FNIP1Q8TF40 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FNIP1Q8TF40 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FNIP1Q8TF40 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FNIP1Q8TF40 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FNIP1Q8TF40 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FNIP1Q8TF40 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FNIP1Q8TF40 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FNIP1Q8TF40 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FNIP1Q8TF40 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FNIP1Q8TF40 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FNIP1Q8TF40 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FNIP1Q8TF40 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FNIP1Q8TF40 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FNIP1Q8TF40 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FNIP1Q8TF40 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FNIP1Q8TF40 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms