Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
DDX54Q8TDD1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
DDX54Q8TDD1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
DDX54Q8TDD1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
DDX54Q8TDD1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
DDX54Q8TDD1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
DDX54Q8TDD1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
DDX54Q8TDD1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
DDX54Q8TDD1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
DDX54Q8TDD1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
DDX54Q8TDD1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
DDX54Q8TDD1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
DDX54Q8TDD1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
DDX54Q8TDD1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
DDX54Q8TDD1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
DDX54Q8TDD1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
DDX54Q8TDD1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
DDX54Q8TDD1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
DDX54Q8TDD1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
DDX54Q8TDD1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
DDX54Q8TDD1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
DDX54Q8TDD1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
DDX54Q8TDD1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
DDX54Q8TDD1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
DDX54Q8TDD1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
DDX54Q8TDD1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
DDX54Q8TDD1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
DDX54Q8TDD1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
DDX54Q8TDD1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
DDX54Q8TDD1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
DDX54Q8TDD1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
DDX54Q8TDD1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
DDX54Q8TDD1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
DDX54Q8TDD1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
DDX54Q8TDD1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
DDX54Q8TDD1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
DDX54Q8TDD1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
DDX54Q8TDD1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
DDX54Q8TDD1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
DDX54Q8TDD1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
DDX54Q8TDD1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
DDX54Q8TDD1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
DDX54Q8TDD1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
DDX54Q8TDD1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
DDX54Q8TDD1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
DDX54Q8TDD1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
DDX54Q8TDD1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
DDX54Q8TDD1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
DDX54Q8TDD1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
DDX54Q8TDD1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
DDX54Q8TDD1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
DDX54Q8TDD1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
DDX54Q8TDD1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
DDX54Q8TDD1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
DDX54Q8TDD1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
DDX54Q8TDD1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
DDX54Q8TDD1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
DDX54Q8TDD1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
DDX54Q8TDD1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
DDX54Q8TDD1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
DDX54Q8TDD1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
DDX54Q8TDD1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
DDX54Q8TDD1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
DDX54Q8TDD1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
DDX54Q8TDD1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
DDX54Q8TDD1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
DDX54Q8TDD1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
DDX54Q8TDD1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
DDX54Q8TDD1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
DDX54Q8TDD1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
DDX54Q8TDD1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
DDX54Q8TDD1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
DDX54Q8TDD1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
DDX54Q8TDD1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
DDX54Q8TDD1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
DDX54Q8TDD1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
DDX54Q8TDD1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
DDX54Q8TDD1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
DDX54Q8TDD1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
DDX54Q8TDD1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
DDX54Q8TDD1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
DDX54Q8TDD1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
DDX54Q8TDD1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
DDX54Q8TDD1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
DDX54Q8TDD1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
DDX54Q8TDD1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
DDX54Q8TDD1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
DDX54Q8TDD1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
DDX54Q8TDD1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
DDX54Q8TDD1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
DDX54Q8TDD1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
DDX54Q8TDD1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
DDX54Q8TDD1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
DDX54Q8TDD1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
DDX54Q8TDD1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
DDX54Q8TDD1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
DDX54Q8TDD1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
DDX54Q8TDD1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
DDX54Q8TDD1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
DDX54Q8TDD1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms