Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBR5

CIRBP-AS1, Putative uncharacterized protein CIRBP-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBP-AS1Q8TBR5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CIRBP-AS1Q8TBR5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIRBP-AS1Q8TBR5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms