Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB24

RIN3, Ras and Rab interactor 3, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIN3Q8TB24 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RIN3Q8TB24 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RIN3Q8TB24 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIN3Q8TB24 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIN3Q8TB24 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIN3Q8TB24 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIN3Q8TB24 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RIN3Q8TB24 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIN3Q8TB24 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIN3Q8TB24 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIN3Q8TB24 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIN3Q8TB24 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIN3Q8TB24 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIN3Q8TB24 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIN3Q8TB24 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIN3Q8TB24 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIN3Q8TB24 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIN3Q8TB24 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIN3Q8TB24 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIN3Q8TB24 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIN3Q8TB24 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIN3Q8TB24 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIN3Q8TB24 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIN3Q8TB24 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIN3Q8TB24 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIN3Q8TB24 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIN3Q8TB24 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIN3Q8TB24 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RIN3Q8TB24 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIN3Q8TB24 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIN3Q8TB24 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIN3Q8TB24 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIN3Q8TB24 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RIN3Q8TB24 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RIN3Q8TB24 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RIN3Q8TB24 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIN3Q8TB24 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIN3Q8TB24 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIN3Q8TB24 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RIN3Q8TB24 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIN3Q8TB24 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIN3Q8TB24 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIN3Q8TB24 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIN3Q8TB24 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIN3Q8TB24 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIN3Q8TB24 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIN3Q8TB24 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIN3Q8TB24 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIN3Q8TB24 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIN3Q8TB24 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIN3Q8TB24 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIN3Q8TB24 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIN3Q8TB24 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIN3Q8TB24 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIN3Q8TB24 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIN3Q8TB24 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIN3Q8TB24 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIN3Q8TB24 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIN3Q8TB24 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIN3Q8TB24 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIN3Q8TB24 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIN3Q8TB24 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIN3Q8TB24 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIN3Q8TB24 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIN3Q8TB24 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIN3Q8TB24 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIN3Q8TB24 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIN3Q8TB24 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIN3Q8TB24 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIN3Q8TB24 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RIN3Q8TB24 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIN3Q8TB24 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIN3Q8TB24 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIN3Q8TB24 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIN3Q8TB24 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIN3Q8TB24 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIN3Q8TB24 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIN3Q8TB24 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIN3Q8TB24 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIN3Q8TB24 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIN3Q8TB24 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIN3Q8TB24 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIN3Q8TB24 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIN3Q8TB24 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIN3Q8TB24 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIN3Q8TB24 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIN3Q8TB24 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RIN3Q8TB24 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RIN3Q8TB24 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIN3Q8TB24 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIN3Q8TB24 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIN3Q8TB24 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIN3Q8TB24 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIN3Q8TB24 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIN3Q8TB24 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RIN3Q8TB24 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIN3Q8TB24 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIN3Q8TB24 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RIN3Q8TB24 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIN3Q8TB24 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms