Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAU0

NKX2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-3Q8TAU0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NKX2-3Q8TAU0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NKX2-3Q8TAU0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NKX2-3Q8TAU0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NKX2-3Q8TAU0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NKX2-3Q8TAU0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NKX2-3Q8TAU0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NKX2-3Q8TAU0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NKX2-3Q8TAU0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NKX2-3Q8TAU0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NKX2-3Q8TAU0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NKX2-3Q8TAU0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
NKX2-3Q8TAU0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NKX2-3Q8TAU0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NKX2-3Q8TAU0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NKX2-3Q8TAU0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NKX2-3Q8TAU0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NKX2-3Q8TAU0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NKX2-3Q8TAU0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NKX2-3Q8TAU0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NKX2-3Q8TAU0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NKX2-3Q8TAU0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NKX2-3Q8TAU0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NKX2-3Q8TAU0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NKX2-3Q8TAU0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NKX2-3Q8TAU0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NKX2-3Q8TAU0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NKX2-3Q8TAU0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NKX2-3Q8TAU0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NKX2-3Q8TAU0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NKX2-3Q8TAU0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NKX2-3Q8TAU0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NKX2-3Q8TAU0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NKX2-3Q8TAU0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NKX2-3Q8TAU0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
NKX2-3Q8TAU0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NKX2-3Q8TAU0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NKX2-3Q8TAU0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NKX2-3Q8TAU0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NKX2-3Q8TAU0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NKX2-3Q8TAU0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NKX2-3Q8TAU0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NKX2-3Q8TAU0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NKX2-3Q8TAU0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NKX2-3Q8TAU0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NKX2-3Q8TAU0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NKX2-3Q8TAU0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NKX2-3Q8TAU0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NKX2-3Q8TAU0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NKX2-3Q8TAU0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NKX2-3Q8TAU0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NKX2-3Q8TAU0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NKX2-3Q8TAU0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NKX2-3Q8TAU0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NKX2-3Q8TAU0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NKX2-3Q8TAU0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NKX2-3Q8TAU0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NKX2-3Q8TAU0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NKX2-3Q8TAU0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NKX2-3Q8TAU0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NKX2-3Q8TAU0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NKX2-3Q8TAU0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NKX2-3Q8TAU0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NKX2-3Q8TAU0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NKX2-3Q8TAU0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NKX2-3Q8TAU0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NKX2-3Q8TAU0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NKX2-3Q8TAU0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NKX2-3Q8TAU0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NKX2-3Q8TAU0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NKX2-3Q8TAU0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NKX2-3Q8TAU0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NKX2-3Q8TAU0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NKX2-3Q8TAU0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NKX2-3Q8TAU0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
NKX2-3Q8TAU0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NKX2-3Q8TAU0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NKX2-3Q8TAU0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NKX2-3Q8TAU0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NKX2-3Q8TAU0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NKX2-3Q8TAU0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NKX2-3Q8TAU0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NKX2-3Q8TAU0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NKX2-3Q8TAU0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NKX2-3Q8TAU0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NKX2-3Q8TAU0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NKX2-3Q8TAU0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NKX2-3Q8TAU0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NKX2-3Q8TAU0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NKX2-3Q8TAU0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NKX2-3Q8TAU0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NKX2-3Q8TAU0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NKX2-3Q8TAU0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NKX2-3Q8TAU0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NKX2-3Q8TAU0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NKX2-3Q8TAU0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NKX2-3Q8TAU0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NKX2-3Q8TAU0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NKX2-3Q8TAU0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NKX2-3Q8TAU0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.5 ms