Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHW4

CCL4L1, C-C motif chemokine 4-like, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4L1Q8NHW4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCL4L1Q8NHW4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCL4L1Q8NHW4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCL4L1Q8NHW4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCL4L1Q8NHW4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCL4L1Q8NHW4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCL4L1Q8NHW4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCL4L1Q8NHW4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCL4L1Q8NHW4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCL4L1Q8NHW4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCL4L1Q8NHW4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCL4L1Q8NHW4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCL4L1Q8NHW4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCL4L1Q8NHW4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCL4L1Q8NHW4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCL4L1Q8NHW4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCL4L1Q8NHW4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCL4L1Q8NHW4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCL4L1Q8NHW4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCL4L1Q8NHW4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCL4L1Q8NHW4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCL4L1Q8NHW4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCL4L1Q8NHW4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCL4L1Q8NHW4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCL4L1Q8NHW4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCL4L1Q8NHW4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCL4L1Q8NHW4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCL4L1Q8NHW4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCL4L1Q8NHW4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCL4L1Q8NHW4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCL4L1Q8NHW4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCL4L1Q8NHW4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CCL4L1Q8NHW4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCL4L1Q8NHW4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCL4L1Q8NHW4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCL4L1Q8NHW4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCL4L1Q8NHW4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCL4L1Q8NHW4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCL4L1Q8NHW4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCL4L1Q8NHW4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CCL4L1Q8NHW4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCL4L1Q8NHW4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCL4L1Q8NHW4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCL4L1Q8NHW4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCL4L1Q8NHW4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCL4L1Q8NHW4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCL4L1Q8NHW4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCL4L1Q8NHW4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCL4L1Q8NHW4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCL4L1Q8NHW4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCL4L1Q8NHW4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL4L1Q8NHW4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL4L1Q8NHW4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL4L1Q8NHW4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL4L1Q8NHW4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL4L1Q8NHW4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL4L1Q8NHW4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL4L1Q8NHW4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms