Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS4

CLHC1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLHC1Q8NHS4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLHC1Q8NHS4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLHC1Q8NHS4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLHC1Q8NHS4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLHC1Q8NHS4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLHC1Q8NHS4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CLHC1Q8NHS4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLHC1Q8NHS4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLHC1Q8NHS4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLHC1Q8NHS4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLHC1Q8NHS4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLHC1Q8NHS4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLHC1Q8NHS4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLHC1Q8NHS4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLHC1Q8NHS4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLHC1Q8NHS4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLHC1Q8NHS4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLHC1Q8NHS4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLHC1Q8NHS4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLHC1Q8NHS4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLHC1Q8NHS4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLHC1Q8NHS4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLHC1Q8NHS4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLHC1Q8NHS4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLHC1Q8NHS4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLHC1Q8NHS4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLHC1Q8NHS4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLHC1Q8NHS4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLHC1Q8NHS4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLHC1Q8NHS4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLHC1Q8NHS4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CLHC1Q8NHS4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLHC1Q8NHS4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLHC1Q8NHS4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLHC1Q8NHS4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLHC1Q8NHS4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLHC1Q8NHS4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLHC1Q8NHS4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLHC1Q8NHS4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLHC1Q8NHS4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLHC1Q8NHS4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLHC1Q8NHS4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLHC1Q8NHS4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLHC1Q8NHS4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLHC1Q8NHS4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLHC1Q8NHS4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLHC1Q8NHS4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLHC1Q8NHS4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLHC1Q8NHS4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CLHC1Q8NHS4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLHC1Q8NHS4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLHC1Q8NHS4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLHC1Q8NHS4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLHC1Q8NHS4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLHC1Q8NHS4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLHC1Q8NHS4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLHC1Q8NHS4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLHC1Q8NHS4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms