Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU4

FDCSP, Follicular dendritic cell secreted peptide, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDCSPQ8NFU4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FDCSPQ8NFU4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FDCSPQ8NFU4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FDCSPQ8NFU4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FDCSPQ8NFU4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FDCSPQ8NFU4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FDCSPQ8NFU4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FDCSPQ8NFU4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FDCSPQ8NFU4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FDCSPQ8NFU4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FDCSPQ8NFU4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FDCSPQ8NFU4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FDCSPQ8NFU4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FDCSPQ8NFU4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FDCSPQ8NFU4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FDCSPQ8NFU4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FDCSPQ8NFU4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FDCSPQ8NFU4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FDCSPQ8NFU4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FDCSPQ8NFU4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FDCSPQ8NFU4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FDCSPQ8NFU4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FDCSPQ8NFU4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FDCSPQ8NFU4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FDCSPQ8NFU4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FDCSPQ8NFU4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FDCSPQ8NFU4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FDCSPQ8NFU4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FDCSPQ8NFU4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FDCSPQ8NFU4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FDCSPQ8NFU4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FDCSPQ8NFU4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FDCSPQ8NFU4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FDCSPQ8NFU4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FDCSPQ8NFU4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FDCSPQ8NFU4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FDCSPQ8NFU4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FDCSPQ8NFU4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FDCSPQ8NFU4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FDCSPQ8NFU4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FDCSPQ8NFU4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FDCSPQ8NFU4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FDCSPQ8NFU4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FDCSPQ8NFU4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FDCSPQ8NFU4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FDCSPQ8NFU4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FDCSPQ8NFU4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FDCSPQ8NFU4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FDCSPQ8NFU4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FDCSPQ8NFU4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FDCSPQ8NFU4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FDCSPQ8NFU4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FDCSPQ8NFU4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FDCSPQ8NFU4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FDCSPQ8NFU4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FDCSPQ8NFU4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FDCSPQ8NFU4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FDCSPQ8NFU4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FDCSPQ8NFU4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FDCSPQ8NFU4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FDCSPQ8NFU4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FDCSPQ8NFU4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FDCSPQ8NFU4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FDCSPQ8NFU4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FDCSPQ8NFU4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FDCSPQ8NFU4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FDCSPQ8NFU4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FDCSPQ8NFU4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FDCSPQ8NFU4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FDCSPQ8NFU4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FDCSPQ8NFU4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FDCSPQ8NFU4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FDCSPQ8NFU4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FDCSPQ8NFU4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FDCSPQ8NFU4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FDCSPQ8NFU4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FDCSPQ8NFU4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FDCSPQ8NFU4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms