Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC148Q8NFR7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC148Q8NFR7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC148Q8NFR7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC148Q8NFR7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC148Q8NFR7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC148Q8NFR7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC148Q8NFR7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC148Q8NFR7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC148Q8NFR7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC148Q8NFR7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC148Q8NFR7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC148Q8NFR7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC148Q8NFR7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC148Q8NFR7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC148Q8NFR7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC148Q8NFR7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CCDC148Q8NFR7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC148Q8NFR7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC148Q8NFR7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC148Q8NFR7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC148Q8NFR7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC148Q8NFR7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC148Q8NFR7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC148Q8NFR7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC148Q8NFR7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC148Q8NFR7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC148Q8NFR7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC148Q8NFR7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC148Q8NFR7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC148Q8NFR7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC148Q8NFR7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC148Q8NFR7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC148Q8NFR7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC148Q8NFR7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC148Q8NFR7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC148Q8NFR7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC148Q8NFR7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC148Q8NFR7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC148Q8NFR7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC148Q8NFR7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC148Q8NFR7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC148Q8NFR7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC148Q8NFR7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC148Q8NFR7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC148Q8NFR7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC148Q8NFR7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC148Q8NFR7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC148Q8NFR7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC148Q8NFR7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC148Q8NFR7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC148Q8NFR7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC148Q8NFR7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC148Q8NFR7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC148Q8NFR7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC148Q8NFR7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC148Q8NFR7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC148Q8NFR7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC148Q8NFR7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC148Q8NFR7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC148Q8NFR7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC148Q8NFR7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC148Q8NFR7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC148Q8NFR7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC148Q8NFR7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC148Q8NFR7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC148Q8NFR7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC148Q8NFR7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC148Q8NFR7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC148Q8NFR7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC148Q8NFR7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC148Q8NFR7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC148Q8NFR7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC148Q8NFR7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC148Q8NFR7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC148Q8NFR7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC148Q8NFR7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC148Q8NFR7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC148Q8NFR7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC148Q8NFR7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC148Q8NFR7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC148Q8NFR7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC148Q8NFR7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC148Q8NFR7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC148Q8NFR7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC148Q8NFR7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC148Q8NFR7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC148Q8NFR7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC148Q8NFR7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC148Q8NFR7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC148Q8NFR7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC148Q8NFR7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC148Q8NFR7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC148Q8NFR7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC148Q8NFR7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC148Q8NFR7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC148Q8NFR7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC148Q8NFR7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC148Q8NFR7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC148Q8NFR7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms