Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NUP35Q8NFH5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP35Q8NFH5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP35Q8NFH5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP35Q8NFH5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP35Q8NFH5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP35Q8NFH5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP35Q8NFH5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP35Q8NFH5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP35Q8NFH5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP35Q8NFH5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP35Q8NFH5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP35Q8NFH5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP35Q8NFH5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP35Q8NFH5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP35Q8NFH5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP35Q8NFH5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP35Q8NFH5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP35Q8NFH5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP35Q8NFH5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP35Q8NFH5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP35Q8NFH5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP35Q8NFH5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP35Q8NFH5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP35Q8NFH5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP35Q8NFH5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP35Q8NFH5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP35Q8NFH5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP35Q8NFH5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP35Q8NFH5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP35Q8NFH5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP35Q8NFH5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP35Q8NFH5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP35Q8NFH5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP35Q8NFH5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP35Q8NFH5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP35Q8NFH5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP35Q8NFH5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP35Q8NFH5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms