Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSNK2A3Q8NEV1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CSNK2A3Q8NEV1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSNK2A3Q8NEV1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSNK2A3Q8NEV1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSNK2A3Q8NEV1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSNK2A3Q8NEV1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSNK2A3Q8NEV1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSNK2A3Q8NEV1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSNK2A3Q8NEV1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSNK2A3Q8NEV1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSNK2A3Q8NEV1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSNK2A3Q8NEV1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSNK2A3Q8NEV1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSNK2A3Q8NEV1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSNK2A3Q8NEV1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSNK2A3Q8NEV1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSNK2A3Q8NEV1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSNK2A3Q8NEV1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSNK2A3Q8NEV1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSNK2A3Q8NEV1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSNK2A3Q8NEV1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSNK2A3Q8NEV1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CSNK2A3Q8NEV1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSNK2A3Q8NEV1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK2A3Q8NEV1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK2A3Q8NEV1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK2A3Q8NEV1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK2A3Q8NEV1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK2A3Q8NEV1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK2A3Q8NEV1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK2A3Q8NEV1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSNK2A3Q8NEV1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSNK2A3Q8NEV1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSNK2A3Q8NEV1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSNK2A3Q8NEV1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSNK2A3Q8NEV1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CSNK2A3Q8NEV1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK2A3Q8NEV1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK2A3Q8NEV1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK2A3Q8NEV1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK2A3Q8NEV1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK2A3Q8NEV1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK2A3Q8NEV1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK2A3Q8NEV1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK2A3Q8NEV1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK2A3Q8NEV1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK2A3Q8NEV1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK2A3Q8NEV1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK2A3Q8NEV1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK2A3Q8NEV1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK2A3Q8NEV1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK2A3Q8NEV1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSNK2A3Q8NEV1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSNK2A3Q8NEV1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSNK2A3Q8NEV1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK2A3Q8NEV1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK2A3Q8NEV1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK2A3Q8NEV1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK2A3Q8NEV1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSNK2A3Q8NEV1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSNK2A3Q8NEV1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSNK2A3Q8NEV1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSNK2A3Q8NEV1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSNK2A3Q8NEV1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSNK2A3Q8NEV1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSNK2A3Q8NEV1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSNK2A3Q8NEV1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSNK2A3Q8NEV1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSNK2A3Q8NEV1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSNK2A3Q8NEV1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms