Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM2

SHCBP1, SHC SH2 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHCBP1Q8NEM2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SHCBP1Q8NEM2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SHCBP1Q8NEM2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SHCBP1Q8NEM2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SHCBP1Q8NEM2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SHCBP1Q8NEM2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SHCBP1Q8NEM2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SHCBP1Q8NEM2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SHCBP1Q8NEM2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SHCBP1Q8NEM2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SHCBP1Q8NEM2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SHCBP1Q8NEM2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHCBP1Q8NEM2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SHCBP1Q8NEM2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHCBP1Q8NEM2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHCBP1Q8NEM2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHCBP1Q8NEM2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHCBP1Q8NEM2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHCBP1Q8NEM2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHCBP1Q8NEM2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHCBP1Q8NEM2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHCBP1Q8NEM2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHCBP1Q8NEM2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHCBP1Q8NEM2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHCBP1Q8NEM2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SHCBP1Q8NEM2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SHCBP1Q8NEM2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SHCBP1Q8NEM2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SHCBP1Q8NEM2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SHCBP1Q8NEM2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SHCBP1Q8NEM2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SHCBP1Q8NEM2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SHCBP1Q8NEM2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SHCBP1Q8NEM2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SHCBP1Q8NEM2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SHCBP1Q8NEM2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SHCBP1Q8NEM2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SHCBP1Q8NEM2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHCBP1Q8NEM2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHCBP1Q8NEM2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHCBP1Q8NEM2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHCBP1Q8NEM2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SHCBP1Q8NEM2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SHCBP1Q8NEM2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SHCBP1Q8NEM2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHCBP1Q8NEM2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHCBP1Q8NEM2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHCBP1Q8NEM2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHCBP1Q8NEM2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHCBP1Q8NEM2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHCBP1Q8NEM2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHCBP1Q8NEM2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHCBP1Q8NEM2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHCBP1Q8NEM2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHCBP1Q8NEM2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHCBP1Q8NEM2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SHCBP1Q8NEM2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SHCBP1Q8NEM2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SHCBP1Q8NEM2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SHCBP1Q8NEM2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SHCBP1Q8NEM2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SHCBP1Q8NEM2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHCBP1Q8NEM2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SHCBP1Q8NEM2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHCBP1Q8NEM2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHCBP1Q8NEM2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHCBP1Q8NEM2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHCBP1Q8NEM2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHCBP1Q8NEM2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHCBP1Q8NEM2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHCBP1Q8NEM2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHCBP1Q8NEM2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHCBP1Q8NEM2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHCBP1Q8NEM2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHCBP1Q8NEM2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHCBP1Q8NEM2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHCBP1Q8NEM2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHCBP1Q8NEM2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHCBP1Q8NEM2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHCBP1Q8NEM2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHCBP1Q8NEM2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SHCBP1Q8NEM2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SHCBP1Q8NEM2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHCBP1Q8NEM2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHCBP1Q8NEM2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHCBP1Q8NEM2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHCBP1Q8NEM2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHCBP1Q8NEM2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHCBP1Q8NEM2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHCBP1Q8NEM2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SHCBP1Q8NEM2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHCBP1Q8NEM2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SHCBP1Q8NEM2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SHCBP1Q8NEM2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SHCBP1Q8NEM2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SHCBP1Q8NEM2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SHCBP1Q8NEM2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SHCBP1Q8NEM2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SHCBP1Q8NEM2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SHCBP1Q8NEM2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms